共通の敵。 本名：セバスチャン 身長 350m（スピア含む） 数多くのマルチバースを破壊し、タイタンたちの魂を吸収した。コアから武器を取り出して装着できる。 ただし、右手を「誰か」に破壊された状態である。 装備：クロックワイズ・キャノン クロックワイズを殺して手に入れたキャノン。出力が非常に強い。 アストラルソード 神々を殺す剣。老化不可、破壊不可。剣で斬られた傷はいかなる方法でも再生不可。 ダインスレイヴ 結晶が埋め込まれたアストラルソードの形態。地面に突き刺して自分を封印できる。また、この剣で斬られると全身が結晶化する。 時間核爆弾 作動させるとマルチバースの一つの次元を蒸発させることができる爆弾。時計が12時になると爆発する。 クロノスピア 誘導型の矢針5本。背後の肩に並んで配置されており、速度が非常に速い。威力も十分である。 重力子弾 腰にぶら下がっている楕円形の武器。 作動させた瞬間、使用者以外のすべての重力が50倍に増加する。破壊可能。 能力 時間停止 銀河系を停止させる力を持つ。ただし範囲が広いほど持続時間は短くなる。 未来予知 フューチャークロックとは異なり、制限なく未来を見ることができる。 次元移動 時計の音が鳴り、瞬時に次元移動を行う。黒赤色のブラックホールの中に消え、再び現れる時も黒赤色のブラックホールが生じる。 反射 投射物を剣で反射できる。反射する際に時計の秒針の音がする。 時間逆行 時間を巻き戻すことができる。自分の傷に時間逆行を使えば、傷のない時点に戻る。 時間減速 自分が望む分だけ時間を遅くする。 数秒を千年のように感じさせることも可能。 幻覚 敵に幻覚を見せて戦闘を撹乱する。例えば、自分の分身を召喚する幻覚など。

味方側 身長：100m 本名：ベンジャミン 性別：男性 最強のタイタンとして知られている。 シニスターと唯一対抗できる（覚醒限定）。 装備：聖剣 超大型の時計で作られた大剣。 現在はアストラルソードによって破壊されている。 黄金の甲冑 シニスターと似た甲冑を着用。 耐久力が非常に高く、敵から簡単にダメージを受けない。 懐中時計 精神操作能力を持っている。相手に付着させて精神操作を行う。一言で言えば催眠。 クロックカッタークロウ 背中の時計塔の横に3つずつ両側に分かれており、誘導機能がある。中型トイレ一つくらいなら簡単に切り裂く威力。 クロック機関銃 手を機関銃に換装して発射できる。発射体が当たると対象は時間停止する。 アストラルソード シニスタータイタンクロックマンと同じ武器。ただし柄がある。 代表能力 時間停止 時間を停止させる能力。 インフィニティブースト 一時的に戦闘力を数倍に高めるが、コアに過負荷がかかる。他の味方にエネルギーを分けることもできる。 重力逆転 重力を逆転させ、重力を軽くしたり重くしたりできる。 覚醒 自身の真の力を発揮して覚醒できる。ただし覚醒するにはチーフクロック（現在は魂の状態）に会い、力を得る必要がある。

陣営：連合軍直属 種族：ペンシルマン 性格：他のマルチバースのCペンとは異なり、唯一心優しい。他のマルチバースの自分が子供たちを殺したことを知り、罪悪感に陥っている。 外見：他の次元のマルチバースとは異なり、サイズが大型クロックマン程度に縮小した姿。白い軍帽と将校服を着用している。 性別：男性 職位：研究員 次元：ユニバース404（滅亡） ソルと非常に親しい仲であり、自分の次元でソルと共に「時間核爆弾」を作り上げた。現在はシニスタータイタンクロックマンに強奪されている。自分の次元も時間核爆弾によって消滅した。ユニバース404のソルと共に唯一の生存者。

名前：ソル（本名） 性別：男性 身長：（不明。おそらく中型クロックマン程度） 性格：研究員出身で連合軍の研究を執刀しており、クリスターと同様に心優しく善良である。 次元：ユニバース404（滅亡） 職位：研究員 外見： 外骨格が露出した時計の姿をしており、鼻のように突き出た鉄筋のせいでピノキオを連想させることもある。 クリスターと非常に格別な仲であり、研究員出身かつユニバース次元404の生存者のうち、クリスターと共に唯一の生存者である。クリスターと共に「時間核爆弾」を研究し作り上げた。

陣営：連合軍 次元：トランスフォーマー・マルチバース 性別：男性 職位：タイタン直属 性格：仲間を大切にし、シニスターを非常に敵視している。 外見：服を着ていた原作のタイタンとは異なり、完全なロボットの形態をとっている。タイタンドリルマンのように全身に厚い甲冑を着用しており、全体的に重厚な姿である。 装備 エネルゴンハンマー 近接武器。右手を巨大なエネルギーハンマーに変形させて振り回すことができる。破壊力は凄まじいが、攻撃速度は少し遅い。 エネルギーレーザーガン 遠距離武器。 右手に巨大なレーザーガンを生成して攻撃する。左腕にも同様の武器が付いている。 ジェットパック・レーザーキャノン ジェットパックに付いている遠距離武器。補助武器であり、戦闘機に変身すると本格的に使用する。 能力 変身：体をジェット機、すなわち戦闘機に変身させ、空中を飛び回りながら攻撃できる。破壊力は非常に凄まじい。