トウヤ・トウコ スマートそうな男の子と活発そうな女の子の主人公。 チェレン トウヤとトウコの幼馴染。眼鏡をかけた知的な男の子。気難しいところはあるが真っ直ぐな性格。ポケモンに関する知識は豊富でトウヤとトウコにアドバイスをくれる事もある。面倒な事が嫌いで、またよく「メンドー」と口にしており一種の口癖でもあるらしい ベル トウヤとトウコの幼馴染。金髪で緑のベレー帽を被った女の子。少しマイペースだが頑張り屋な性格。時々勘の良い面を見せる。チェレンと同様に旅先で頻繁にポケモンバトルを仕掛けてくる。見かけによらず芯はしっかりしる。ライモンジムリーダーのカミツレに憧れている アララギ博士 イッシュ地方のポケモン研究者で、「ポケモンの起源」を研究している。研究者としてはまだ駆け出しで、元気で快活な性格をしており、「ハーイ!」が口癖。タイトなスカートを履いているが、靴はヒールでなくスニーカーである。トウコたちの近所に住んでおり、彼らとは歳の離れた姉といった仲である マコモ サンヨウシティに住む研究者で、自称「夢見る乙女」。アララギ博士とは大学時代からの親友。膝下まである長髪と花柄の髪留めが特徴の女性。トレーナーのレポートを集めるためのシステムを構築している。 ショウロ マコモの妹。今作のポケモンボックスの管理人。姉の研究のお手伝いをしており、バトルボックスやともだちてちょうの説明をしてくれる ポッド ほのおタイプのポケモン使いのサンヨウシティジムリーダー。赤い髪で元気でやんちゃだが少々せっかちな少年で、兄弟の中で一番強いと自称している。 コーン みずタイプのポケモンの使い手のサンヨウシティジムリーダー。 青い髪で右目を隠している知的な自信家だが少しナルシストな少年で、一人称は「コーン」 デント くさタイプのポケモンの使い手で、くさタイプの使い手のサンヨウシティジムリーダー。 緑の髪で礼儀正しく穏やかな少年だが二人とは微妙にズレている アロエ シッポウジムリーダー。ノーマルタイプのポケモンの使い手。性格は快活で肝っ玉。本職は図書館も兼ねた博物館の館長で既婚者で夫は副館長のキダチ アーティ ヒウンジムリーダー。むしタイプのポケモンの使い手。マイペースで飄々とした言動を取るが、本質は真意を付いた発言ができる常識人 カミツレ ライモンジムリーダー。でんきタイプのポケモンの使い手で、一見するとクールな性格を思わせるが、素顔は明るくダジャレ好きでシャイな性格 ヤーコン ホドモエジムリーダー。じめんタイプのポケモンの使い手。本職は「鉱山王」の異名を取る鉱物資源開発の社長で、ゲーチスと互角の交渉で渡り合える一流の商売人 フウロ フキヨセジムリーダー。ひこうタイプのポケモンの使い手。本職は貨物を専属に取り扱う飛行機のパイロットで、イッシュ地方随一と言われる伝説の飛行機乗りの孫娘 ハチク セッカジムリーダー。こおりタイプのポケモンの使い手。元はアクション映画のスター俳優だったが俳優業を引退せざるを得ない怪我を負ったところをアデクに声をかけられポケモンを極める道に進んだ。それ以来アデクとは親交が深い シャガ ソウリュウジムリーダー。ドラゴンタイプのポケモンの使い手。体格の良い老人で、本職はソウリュウシティの市長。 シキミ/四天王 ゴーストタイプのポケモンの使い手。自分のもとに挑戦しに来たトレーナーとポケモンの心の触れ合いを題材に小説を書いてる ギーマ/四天王 あくタイプのポケモンの使い手。勝負師としてポケモンバトルをシビアに考えており独自の勝敗論を持つ カトレア/四天王 エスパータイプのポケモンの使い手。実力者を輩出してきた家系のお嬢様で強力な超能力者 レンブ/四天王 威風堂々とした性格の青年で格闘の道を極めるべく修行を続けている。アデクを師匠と呼び、一番弟子を名乗っている ノボリ・クダリ ライモンシティのバトルサブウェイの舞台となる地下鉄の車掌であると同時に、バトルサブウェイを勝ち進めたトレーナーに対しボスとして立ちはだかる「サブウェイマスター」である凄腕トレーナー。双子であり瓜二つの容姿だが、ノボリは黒、クダリは白を基調とした服装をしている。 アデク イッシュ地方ポケモンリーグチャンピオン。紅く燃えるような髪型をした初老の男性で、歴代でも最高齢のチャンピオン。 N プラズマ団の頂点に君臨する王である青年。未来予知とポケモンの言葉を理解し心を通わせる能力を持っている。ゲーチスとは義理の親子関係。チーゲスから受けてきた教育はもはや洗脳で、幼少期は人間に酷い目に合わされたポケモンと共同生活を送らす。ポケモンと人間は相いれない存在だと教えられた。 ゲーチス 底の見えない落ち着いた喋り方をする。立場上はNの部下に当たり、組織内では「七賢人」に属しているが、事実上組織を牛耳っている人物でプラズマ団を創設した張本人であり、息子であるNを傀儡の王に祭り上げ、自らが実権を握り組織を裏で動かしているプラズマ団の事実上の真の黒幕である ロット/プラズマ団の七賢者 ヴィオ/プラズマ団の七賢者 アスラ/プラズマ団の七賢者 スムラ/プラズマ団の七賢者 リョクシ/プラズマ団の七賢者 ジャロ/プラズマ団の七賢者