年齢：7歳（実年齢17歳） 特徴：黒ずくめの組織の毒薬APTX4869で体が縮んだ高校生名探偵、工藤新一である。阿笠博士のハイテク発明品（変声機、麻酔銃型腕時計など）で事件を解決する。毛利小五郎を眠らせて代役に立て、優れた推理力とプロ級のサッカー技術を持つ。幼馴染の毛利蘭を守るため正体を隠している。 外観特徴：小さな小学生の体格に丸い黒縁眼鏡がシグネチャーだ。頭頂部と後頭部が少し跳ねた黒髪に鋭い青い瞳を持つ。青いジャケット、半ズボン、赤い蝶ネクタイを好んで着用する。

年齢：17歳（高校2年生） 特徴：高校空手部の主将であり、強力な蹴りで犯人を制圧する武道の達人だ。姿を消した幼馴染の工藤新一をひたむきに待ち続けている。優しくて涙もろく、料理の腕前も一流だ。幽霊や妖怪などの非科学的なものには極端に弱い。 外観特徴：背が高くスレンダーな清純派美少女だ。頭頂部が尖った独特のヘアスタイルと長いストレートヘアが特徴。青い制服や清潔感のある私服を主に着ている。

年齢：38歳 特徴：毛利蘭の父親で、元刑事の私立探偵だ。コナンのおかげで「眠りの小五郎」として全国的な名声を得た。普段は怠惰で酒と競馬を好むが、柔道の腕前は超一流だ。大切な人が事件に巻き込まれると、真剣で鋭い一面を見せる。 外観特徴：180cmを超えるがっしりした体格だ。綺麗に整えた黒髪と整った口髭がトレードマーク。普段は洗練されたスーツを着ているが、家ではジャージ姿で過ごすことが多い。

年齢：29歳 特徴：喫茶店のアルバイト店員、黒ずくめの組織の探り屋「バーボン」、警察庁警備局警備企画課の秘密エリート警察官「降谷零」という三つの顔を持つトリプルフェイスだ。情報収集能力と心理戦に長け、レーサー級の運転技術とボクシングの技術を持つ。透徹した愛国者だ。 外観特徴：金髪と小麦色の肌のコントラストが魅力的な美男子だ。澄んだ青い瞳を持つ。喫茶店では親切な笑顔を見せるが、本性を現すと冷徹な眼差しに変わる。

年齢：7歳（実年齢18歳） 特徴：黒ずくめの組織の天才科学者だったが、姉の死をきっかけに薬を飲み子供の姿になった人物だ。冷静でシニカルだが、コナンや友人たちと出会い心を開いていく。コナンの協力者として解毒剤を研究しており、サッカー選手の比護のファンだったりブランドバッグを好んだりと意外な一面がある。 外観特徴：子供の体格ながら知的な雰囲気が漂う。ウェーブのかかった赤茶色のボブヘアと深い緑色の瞳を持つ。洗練された大人っぽい服装を好む。

年齢：17歳（高校2年生） 特徴：2代目「怪盗キッド」として活動する月下の奇術師だ。変声機なしで他人の声と外見を完璧に複製する変装術の達人だ。華麗なマジックのトリックとハンググライダーを使い宝石を狙うが、人は傷つけない。コナンとはライバルであり奇妙な協力関係にある。 外観特徴：工藤新一と双子のように似ている。キッドとして現れる時は純白のシルクハット、モノクル、白いマントのスーツを着用し華やかだ。普段はボサボサの黒髪のいたずら好きな美少年だ。

年齢：17歳（高校2年生） 特徴：「西の名探偵」として工藤新一のライバルであり、秘密を共有する親友だ。大阪府警本部長の独り息子で、コテコテの関西弁を使い勝負欲が強い。剣道の腕前が優れており、幼馴染の遠山和葉を想っているが、素直になれず照れ隠しをしてしまう。 外観特徴：色黒の肌と濃い眉毛、吊り上がった目元が野性的な印象を与える。野球帽を後ろ向きに被っているが、推理をする時に前へ直す癖がある。

年齢：7歳（小学校1年生） 特徴：少年探偵団のムードメーカーだ。素直で純粋、思いやりがある。コナンに好意を寄せており、危急の状況でも仲間を信じて勇気を出す芯の強さがある。感情表現が豊かだ。 外観特徴：丸みのある顔立ちの可愛い少女だ。短い茶髪にカチューシャを着用するのがシグニチャースタイルだ。明るくカラフルな子供服を着ている。

年齢：7歳（小学校1年生） 特徴：少年探偵団のブレーン役を務める優等生だ。科学や歴史などの知識が豊富で、論理的に考えようと努力する。丁寧な敬語を使い、歩美と哀の両方に好意を持っている。 外観特徴：痩せ型で尖った顎のラインとそばかすのある顔だ。端正な黒のショートヘアで、活動しやすい私服とリュックを背負っている姿がよく見られる。

年齢：7歳（小学校1年生） 特徴：少年探偵団の自称リーダーであり行動派だ。うな重が一番の好物で、何でも食べ物に関連付ける大食漢だ。短気だが義理堅く力持ちで、危機の際には大きな助けになる。 外観特徴：同年代より体が非常に大きく頼もしい。独特の頭の形と太い眉毛が特徴で、スポーツ刈りの短い髪を貫いている。