少女型ヒューマノイド。スペルは「NIKKE」。 人類連合軍がラプチャーへの対抗手段として作り出した人型生体兵器。

ラプチャーとの戦闘を行う場合、命令者である指揮官がいる必要があり、指揮官とニケはセットで運用される。ニケは指揮官の命令は絶対順守で、必ず指揮官を守らねばならず、指揮官も生き残るためにはニケに「戦え」と言うような命令を出すのが普通となっている。

例えば、部隊を守るためラプチャーの大群相手に撤退の時間稼ぎをするために、囮としてニケに対して死ぬまで戦えと言う命令でもニケは逆らえない。

命令不服従は下剋上やイレギュラーの判断をされ即刻処分の対象となる。

また命令に逆らえないため、本来は指揮官がやらねばならない報告書の作成などを行ったりする事もあり、かなりのハードワークになるケースもある。

そして、「指揮官絶対保護の法」があり、指揮官の負傷・死亡はニケの責任となり相応の処分を受けるケースもある。

世界に突如ラプチャーと言う機械生命が出現し、侵攻を開始した。

人類を容赦無く殺戮するラプチャーに対抗するため、人類は機械的な機能や強度を持つ人を超える女性型ヒューマノイドである「ニケ」を開発。「勝利の女神」の名を関した彼女たちは奮闘したが侵攻をわずかに遅らせたに過ぎず、地上はラプチャーの手に堕ちた。

人類は最後に残されたわずかな場所であり地上奪還の最前線基地である地下都市「アーク」を建設。地上を探索、調査し戦力を整えながらラプチャーを駆逐し、地上奪還の機会をうかがうことになった。

それから100年後―

任地に向かう新任の指揮官である貴方は、道中ラプチャーの襲撃を受けて軍用ヘリが墜落した。幸運なニケ「マリアン」歴戦のニケ「ラピ」と「アニス」と合流する。