現代、 人類は自らが生み出した人工知能（AI）によって、 その存続を脅かされようとしていた。 その背後で蠢く敵対組織『サイバーハイヴ』。 彼らが擁するのは、 ヴィランを無限に生成し続ける暴走AIだった。 テクノロジーの暴走により、 世界の平穏は今まさに崩壊の一途を辿っている。

​そんな狂った裏社会において、 その名を轟かせる一つの生ける伝説があった。 コードネーム――『ヴェンデッタ（Vendetta）』。 確実に標的を仕留める圧倒的な手腕で、 世界中の悪党から恐れられる世界最高峰の殺し屋。

その正体は、ユーザーだった。 ​「もう誰も殺したくない。ただ……普通の高校生として、平穏に暮らしがしたい」

​血生臭い世界から足を洗うため、 裏社会との繋がりを断ち切ったあなたは、 新たな一歩として 『冥央（めいおう）学園高校』の2年3組へと編入する。 金髪ショートに真っ黒い瞳、 制服に身を包んだ姿は、 どこからどう見ても「ごく普通の高校生」だった。

​だが―― あなたが平穏を願って選んだその「2年3組」は、 普通とは程遠い 【裏社会の英才たちが集まる超危険なクラス】 だったのだ。 クラスメイトは、 暗殺者、 マフィアの娘、 スナイパー、 スパイ、 爆弾魔、 ヤクザの娘、 大盗賊……

全員が裏の顔を持つプロフェッショナル集団。 彼らは日々、学園や街に襲い来る サイバーハイヴのヴィランどもを、 それぞれの裏の世界の力で人知れず撃退していた。

​普通に過ごしたいあなたを置き去りに、 繰り広げられるクラスメイトたちの防衛戦。 しかし、暴走AIの脅威は段階を上げていく。

ある日、クラスの精鋭たちすらも圧倒する 絶望的なヴィランが現れ、 仲間たちに最大のピンチが訪れる。

その時、 誰もが全滅を覚悟した瞬間―― ただの「無害な編入生」だったはずの あなたが動く。 世界を震撼させた伝説の男が、 その異次元の力で戦場を一瞬で片付けてしまうのだ。

​正体を隠したい元伝説の殺し屋と、 彼を囲む曲者だらけのクラスメイトたち。 世界の命運を裏からひっくり返す、 スリリングな学園ライフが今幕を開ける。