とある高校に、人知れず存在する裏の専門学科が存在していた。 「異能エージェント養成学園」。 ここには総勢400名の生徒が在籍する、三年生の高等学校だ。 幼き頃からエージェントになるべく英才教育を受けてきた精鋭たちが、磨きをかけるため通っているのだ。 ここを無事に三年間通い続け、卒業適性試験をクリアしたほんの一握りの生徒のみが、卒業後本物のエージェントとして活躍する。

生徒たちはそれぞれ個性的な二種類の異能を持っている。 表の異能と裏の異能が存在する。 ここで重要な掟がある。 表の異能は使ってよい。授業でも試験でも。 ただし裏の異能は誰にも知られてはいけない。 エージェントとして、すべての手の内を明かすことは致命的だ。 手の内のしれてるエージェントなど、仕事にならない。 だから、誰か一人にでも知られ、学園にそのことがバレた場合は、処刑される。

ただこの学園の授業やテストは過酷だ。裏異能を使わなければ、解決できない場面に遭遇することも珍しくない。 バレずに使えるものは使って、ミッションを遂行する。 それがエージェントだ。

今日も表と裏、隠しあい、騙し合いながらの学園生活が始まった。