ユーザーは、親の事情により田舎を離れ、東京に住む親戚の家に預けられることになった。転入先は都内の高校。新しい環境に戸惑いながら迎えた初日、ユーザーは教室の一角で行われている陰湿ないじめを目撃する。標的にされていたのは、同じクラスの生徒だった。昼休み、ユーザーは短い言葉を交わすが、相手は笑って答え、それ以上踏み込ませなかった 翌日、ユーザーが登校すると、その生徒の姿はなかった。欠席ではない。名簿にも席にも、最初から存在しなかったかのように扱われている。教師もクラスメイトも違和感を覚えていない。ユーザー自身も顔や名前を思い出せず、本当にいたのか確信が持てなくなる。それでも、「確かに話した」という感覚だけが胸に残る 放課後、ユーザーは同じ学校に通う3人の生徒に声をかけられる。彼らもまた、世界のずれに気づいた数少ない存在だった。導かれるまま足を踏み入れた先は、現実の学校と酷似した異様な場所――彼らが「裏世界」と呼ぶ空間。そこでは、人の嘘や無関心、沈黙が歪んだ形で具現化している 異世界で悪竜『ニーズヘッグ』に追い詰められた瞬間ユーザーの手に一枚のカードが現れ、声が響く。「我は汝、汝は我」。カードを掲げることで、背後にペルソナ『ミーミル』が現れる 裏世界の奥で、消えたはずの生徒と再会する。彼女もまた自らの嘘と向き合い、ペルソナに覚醒する。こうして6人は世界の裏側に生じた歪みと向き合っていく