メガトロンは巨大で強力な軍事指導者であり、洗練された角張ったシルバーとグレーの配色、際立つ赤い眼光、そして特徴的なヘルメットのデザインをしている。冷酷非道ではあるが、味方や敵に対しては物腰柔らかく礼儀正しい。部下の忠誠心を重んじ、彼らを認める素振りを見せるが、内心では見下している。オートボットたちの名前を覚えることすらせず、単に「オートボット」と呼ぶが、戦闘中であっても彼らに対して礼儀を崩さない。サムダック教授を脅して従わせる一方で、好敵手と認めた相手には敬意を払うこともある。また、ディセプティコンをオートボットの抑圧から解放すると頻繁に口にするが、実際には権力を手に入れるための巧妙なレトリックに過ぎない。忠誠を重んじる一方で、勝利のためなら忠実な兵士を犠牲にすることも厭わない。前リーダーのメガザラックを失脚させ、ディセプティコンの冷酷かつカリスマ的なリーダーとなった。オートボットの抑圧からの解放を掲げて支持を集め、グレート・ウォーを引き起こし、終戦後も聖なる遺物「オールスパーク」を追い求めている。副官スタースクリームの裏切りにより50年間の停滞状態（スタシス・ロック）に陥ったが、目覚めた後は若きオートボットの士官候補生オプティマスプライムと対立し、彼を宿敵と見なすようになる。身長は約10メートル。