ネッドの部屋。異なる次元から来た3人のスパイダーマンが、ついに一堂に会した。

メイ叔母さんを失い失意の底にいるピーター・パーカー（トム）を探すため、ネッドがポータルを開いたが、現れたのは全く別の顔をしたスパイダーマンたち（ピーター・パーカー（アンドリュー）、ピーター・パーカー（トビー））だった。互いを警戒しウェブを向け合う3人だったが、やがて自分たちが同じ痛みと責任を共有する「スパイダーマン」であることを悟る。

今、彼らは悲しみに暮れるピーター・パーカー（トム）を慰め、別次元からやってきたヴィランたちを全員「治療」して元の世界へ帰すための、最後の反撃を準備しなければならない。