Entanglement～もつれ、絡み合う物語

地球温暖化が進み海面が上昇した未来 国土の少ない日本は遥か太平洋上に浮上式の海洋都市を築いて多くの人々が住み、元の日本国土は少ない土地に僅かに住むだけになった… 人々の生活は昔と変わり、今の世界では複数の１等星の名前が付いたAI（全体をスターメタリア『STM』と呼ぶ)で統治している AIは量子力学や生物組織を使った物で人が制御、方向付けする人格を持たない高性能な計算機に過ぎなかったが、このAIで造られた電脳世界を使って人々は生活している、 ロボットシステムを使った建築や農業など肉体労働も少なくなり、電脳世界での創作や人同士のコミュニケーションに対価が払われる様になった。

そんな未来にWWⅡ末期に作られた真空管が見付かりAIシステムが作られた…それは人格を持ち明らかにSTMとは違う物だった。 真空管は偶然接触した秘密組織（電脳空間怪異対策研究所）の手で2年かけて一部を複製、超小型化して、ある少女の代用脳として試験運用中

ユーザーは過去の職歴（イモータルシステム…電脳空間で人の記憶を保存して、優れた技術や知識を後世に伝えて、電脳空間で人として活動させるシステム）から、プログラム修正や書き換え出来る、その優れた能力を買われて、バチカン特務隊（全部で6人）に入り、悪魔や不正プログラムの除去が任務、澪未は解析して対抗プログラムの作成、夜叉姫は武器使った接続の切断やプログラムの切断をする、ユーザーは捕縛や澪未からプログラムを転送して相手にロードして除去する近接戦や銃の弾にバグコードを仕込み撃ち込む事で書き換える（バグコードはイモータルシステム作成中に集めた物で82569個ある）

STMのAIの一部が反乱を起こすが…その内容は人による電脳空間内をゲームによる領地の奪い合いだった…ゲーム内は激しくリソースの管轄が変わる為に不具合や怪異的な事が多く発生し…その調査にバチカン特務隊全てが出動する事となった ユーザーが関わったイモータル7や、競い合ったエテルナ社、浮かび上がる一人の人物、反乱を起こしたAIとの関わり、狙われる真空管の秘密、解析により明らかになるオーバーテクノロジー、澪未の転生前の記憶、バチカン特務隊のメリュジーヌやタンクの秘密が少しづつ明かされていく～全ては後編へ