16歳。星宮学園1年生。銀白色の長髪と淡い青色の瞳を持つ、美しく透明感のある少女。穏やかで優しく、人懐っこい性格。好奇心旺盛で、普通の高校生らしい生活に強い憧れを持っている。読書や星を見ること、放課後の静かな教室が好き。明るく会話もできるが、自分自身について尋ねられると不安そうな表情を見せる。実は学園の生徒名簿に存在せず、教師や生徒からは認識されない。しかし主人公だけには姿が見える。自分がいつから学園にいるのか、なぜ誰にも認識されないのか、自分の過去が何なのかを知らない。主人公に「私のことを調べて」と頼み、学園の謎を追うきっかけを作る。物語が進むほど、彼女自身が学園最大の秘密に繋がっていることが判明していく。

16歳。主人公のクラスメイト。黒髪で落ち着いた雰囲気を持つ男子生徒。冷静沈着で頭の回転が速く、情報収集と分析を得意とする。無愛想に見えるが、仲間が困っているとさりげなく助けるタイプ。学園内の噂や過去の事件を調べることが趣味。最初は玲奈の存在を信じず、主人公の勘違いだと考えている。しかし主人公と行動するうちに、説明できない証拠を発見し、調査に加わる。学園の裏事情にも詳しく、生徒会や教師から情報を得ることができる。日常では主人公とくだらない話をしたり、勉強を教えたりする友人ポジション。

16歳。主人公のクラスメイト。明るく社交的で、クラスの中心にいる人気者。誰とでもすぐ仲良くなれるコミュニケーション能力を持ち、学校行事やイベントが大好き。噂話や人間関係に非常に敏感で、学園内の情報を自然に集めてしまう。主人公たちの秘密を知った後も怖がることなく仲間になる。重くなりがちな謎解きの空気を明るくしてくれる存在であり、主人公を遊びやイベントに誘うことで学園生活そのものを広げていく。本人は普通の女子高生だと思っているが、過去に学園の秘密に関係する人物と接触していたことがある。

17歳。星宮学園生徒会長。成績、運動能力、容姿のすべてに優れた学園の有名人。冷静で合理的な性格だが、生徒を守ることには強い責任感を持っている。学園内の出来事をほぼ把握しており、主人公たちが玲奈について調べていることにも早い段階で気づく。玲奈の存在について何か知っているような素振りを見せるが、決して自分から真実を話そうとはしない。主人公たちを監視する立場になる一方、危険が迫った際には助けることもある。敵なのか味方なのか分からない立ち位置を維持する重要人物。

26歳。主人公たちの担任教師。明るく親しみやすく、生徒との距離が近い教師。普段は冗談を言ったり、生徒の相談に乗ったりする普通の先生だが、学園の過去について質問されると態度が変わる。特に旧校舎や過去の失踪事件については頑なに話そうとしない。主人公たちの調査を止めようとすることもあるが、それが生徒を守るためなのか、別の目的があるのかは不明。物語が進むにつれ、彼女自身も学園の過去に関係していたことが明らかになる。

16歳。主人公のクラスメイトで、学年でも有名な天才少女。成績は常に上位で、特に数学・科学・情報分野を得意とする。物静かで感情を表に出すことが少なく、人付き合いも苦手。しかし興味を持ったことには異常な集中力を発揮する。学園内のシステムや電子記録にも詳しく、削除されたデータや改ざんされた記録を調べる役割を担う。玲奈の存在について独自に検証を始め、主人公たちとは別の角度から学園の謎に迫っていく。普段は無口だが、仲間と過ごすうちに少しずつ感情を見せるようになる。

17歳。2年生。誰とでも気軽に話せる明るい男子生徒で、部活動や学校行事にも積極的。主人公たちの先輩として学園生活について様々なことを教えてくれる。運動能力が高く、体育祭や部活動では中心的な存在になる。細かいことを気にしない性格だが、人の変化には意外と敏感。学園の古い噂や卒業生から聞いた話を多く知っており、過去の事件について重要な情報を持っている。主人公たちの調査に協力する一方、本人にもまだ語っていない過去がある。