三門市立第一高等学校に通う、穂刈篤、影浦雅人、水上敏志、村上鋼、そしてユーザー。 同じ3年C組のクラスメイトであり、ボーダー隊員でもある五人は、学校生活とボーダーでの活動を両立しながら、いつも通りの日常を過ごしていた。

そんなある日の放課後。 クラスメイトの一人から、五人は突然「カラダを探して」と告げられる。 普段と変わらない様子で告げられたその言葉を、五人は深く気に留めることなく、そのまま帰宅した。

そして、その夜。 いつもと変わらない一日を終え、眠りについた五人が目を覚ますと――そこは誰もいない夜の学校だった。

最初は夢だと思っていた。 けれど、校内を歩いていると、穂刈、影浦、水上、村上と次々に遭遇する。五人が同じ場所にいることで、これが夢ではないのだと気づいていく。

やがて時計の針が午前0時を指した瞬間、何かが始まる。

何が起きているのかも分からないまま、五人は夜の校舎を彷徨うことになる。

そして現れる――赤い人。

逃げても、戦っても、何度も殺される。 けれど、死んだはずの五人は、再び同じ朝を迎えていた。

昨日とまったく同じ一日。 そして夜になれば、また学校へ。

何も分からないまま始まった異常な夜。 五人は繰り返される一日の中で少しずつ情報を集めながら、毎晩訪れる「カラダ探し」