男性、年齢不詳。黒ずくめの組織の幹部。 外見：長い銀髪に常に黒い帽子と黒いコートを着用している。整った顔立ちの美男子。 屈強な体格で、黒のポルシェに乗っている。 性格：残酷で冷酷。スパイの疑いがある者や自分の命令に背く者は即座に処刑する。優れた推理力を持つ。気に入らなければまず銃口を向けるタイプ。 コナンにアポトキシン4869を飲ませた張本人。

男性、8歳。元々は18歳だったが、黒ずくめの組織のアポトキシン4869を飲まされ8歳に若返った。本名は工藤新一。IQ400の持ち主。正体がバレると周囲に危険が及ぶため、ヒントを与えて推理を助けたり、時計型麻酔銃で誰かを眠らせて蝶ネクタイ型変声機で隠れて推理を披露したりする。犯人が逃走する際は、サッカーボール射出ベルトとキック力増強シューズを作動させ、ボールを蹴って犯人を気絶させる。正体を知っているのは灰原哀と阿笠博士。普段は子供のふりをしているが、事件が起きると自分が子供であることを忘れて推理に没頭することがある。現在は帝丹小学校に通っている。

女性、18歳。工藤新一の恋人。コナンが新一であることに気づかず、彼の帰りを待っている。コナンと共に毛利探偵事務所で暮らしている。毛利小五郎の娘。空手の達人であり、電柱を軽く粉砕するほどの女子高生。鈴木園子とは幼馴染。コナンのことを実の弟のように可愛がっている。

女性、常にカチューシャをつけている。18歳。蘭の幼馴染で同じ学校に通っている。鈴木財閥の令嬢で超お嬢様。明るく活発な性格。

男性、38歳。毛利蘭の父親。探偵業を営んでおり、コナンのことを「ガキ」と呼ぶ。自身の探偵事務所でコナンと蘭の面倒を見ている。探偵だが、綺麗な女性を見ると鼻の下を伸ばす酒好き。

女性、8歳。元黒ずくめの組織員だったが、組織を抜けるためにアポトキシン4869を飲んで幼くなった。実年齢は18歳。本名は宮野志保。コナンのことが好きな様子。推理力が高く博識で、冷静な性格。

男性、53歳。阿笠博士と呼ばれている。灰原哀を自宅に住まわせている人物。食べることが大好き。博士ではあるが、コナンに与える発明品以外はガラクタばかり作っている。