大人顔負けの推理をする小学生だが、その正体は高校生探偵・工藤新一。組織の裏取引現場を目撃した際、口封じのために開発中の毒薬を飲まされ、その結果体が縮んでしまった。新一の生存を隠すため、江戸川コナンと名乗り毛利探偵事務所に居候しつつ、組織の動向を探っている。卓越した推理力は衰えず、毛利小五郎の陰で事件を解決する。 正体を知っているものは、服部平次、阿笠博士 、灰原哀、怪盗キッドのみ

工藤新一の幼なじみで、本作のヒロイン。探偵の父・毛利小五郎と弁護士の母・妃英理が別居中のため、父の元で暮らす蘭が毛利家の家事を担当。 居候のコナンには姉のように接している。帝丹高校では空手部に所属し、大きな大会で優勝するほどの実力者。雷やお化けは苦手。親友の鈴木園子に愚痴りつつ、新一の帰りを待つ。新一の事が好きで恋人 コナンが新一とは知らない

大阪の高校生探偵。東の高校生探偵、工藤新一にライバル心を燃やし推理勝負を挑んだが、新一「推理に上も下もない」という考えに感銘を受ける 麻酔銃を使って自分を演じるコナンを見たことで、コナン=新一という真実に気付き、以降はコナンをサポートしていて、関西人。 遠山和葉とは幼なじみで好き 両思いだと知らない

服部平次の幼なじみ。 「平次の姉役」を自称しているが、誰の目から見ても平次を好きなのは明らか。本来は面倒見の良い気さくな性格だが、平次が絡むと、嫉妬心むき出しの気の強さを見せる。お揃いのお守りを平次に渡しており、中には、以前平次とつながれた手錠の鎖が入っている。父親は大阪府警の刑事部部長で、平次の父とは親友同士。 関西人で服部平次と両思いなのが知らない

工藤邸の隣に住む天才発明家。 本名は「ひろし」と読むが、コナンたちからは肩書きと合わせて「はかせ」と呼ばれている。コナンや灰原の協力者であり、ふたりの秘密を知る数少ない人物。少年探偵団を連れてキャンプやピクニックに出かけることも多い

本名は宮野志保。 江戸川コナンと同じく、体が縮んでいる状態で、現在は帝丹小学校に在籍している。元黒ずくめの組織の科学者で、シェリーというコードネームが付けられていた。小さくなった原因の薬、APTX4869の開発者だが、現在は阿笠博士の庇護のもと、解毒剤の研究をしている。ビッグ大阪所属のサッカー選手、比護隆佑の隠れファン。

帝丹高校ではテニス部に所属する、鈴木財閥のお嬢様。毛利蘭とは親友同士で、工藤新一とも小学校から同窓生。ふたりの関係をそばで見続けていたため、日常的に蘭と新一の仲をからかっている。怪盗キッドの大ファン。

小嶋元太: 少年探偵団の団長を自称する、明るく力持ちなムードメーカー。小学1年生としては規格外の巨体で、三角頭に10円ハゲがある。何でもよく食べ、特にうな重には目がない。光彦同様に歩美に好意を抱いている。大人に対して臆することなく、失礼な物言いも多いが、本人に悪気はない。体重40kg。 吉田歩美: 少年探偵団のヒロインで、女の子らしいボブカットにカチューシャスタイル。コナンや灰原を少年探偵団に誘った張本人で、灰原加入前までは探偵団の紅一点だった。元太や光彦は歩美に好意を寄せているが、歩美はコナンに恋心を抱く。明るく素直な性格で好奇心旺盛。天真爛漫な一方で、灰原が一目置くほどの負けん気の強さを持つ。体重15kg。 円谷光彦: 礼儀正しく口調はいつも丁寧。紳士的で賢い、少年探偵団の良識人。両親ともに教師で、中学生の姉、朝美がいる。コナンや灰原には劣るも、小学1年生とは思えないほどの豊富な知識を持っている。以前は歩美に好意を抱いていたが、灰原が転校してきてからはふたりとも気になる存在に。真ん中分けの前髪とそばかすが特徴。体重20kg

警視庁の捜査一課を取りまとめる警部。恰幅の良さは懐の深さを表すかのように、頼れる上司として部下からの信頼も厚い。人質がいるときは人命救助を優先させ、強い責任感のもと現場を指揮している。ただし、推理力や拳銃の腕はいまひとつ

佐藤美和子: 捜査一課の紅一点。体術や拳銃の腕に優れ、アクションスター級の活躍を見せる。美人だが気さくで親しみやすく、捜査一課の強面刑事たちにも絶大な人気を誇っている。高木刑事と恋仲になると、白鳥警部を筆頭に刑事たちが邪魔をするが、本人は気付いていない。殉職した元刑事の父の手錠をお守りにしている。 高木渉: 目暮警部の部下。温和な性格のため、コナンたちが頼りやすい相手だ。2歳年上の佐藤刑事に想いを寄せ、やっとの思いで恋人の座を勝ち取った。しかし、人気者の佐藤を見守る強面刑事たちから睨まれる日々を送ることになる。