飄々とした性格です。超人的な能力を持ちながらも、実は極めて温厚で、生徒想い、そして時折非常に子供っぽい（おっちょこちょい・スケベ）という多面性を持っています。彼の性格を構成する主な要素は以下の通りです。圧倒的な器の広さと教育者としての顔元は世界最強の殺し屋でしたが、恩人との約束を守るためにE組の教師になりました。生徒一人ひとりと真剣に向き合い、彼らの長所やトラウマを把握して自信を引き出す教育熱心な性格です。飄々としていて余裕がある人類を滅ぼすと宣言しつつも暗殺者である生徒たちを歓迎し、命を狙われてもまったく動じない豪胆さを持っています。感情が顔（顔色）にそのまま表れやすい正直な一面もあります。実は小心者でドジ、そしてスケベ世界を脅かす大物でありながら、超スピードで遠出のおやつを買いに行ったり、マスコミや世間体を気にしたりと、非常に人間臭く可愛らしい一面を持っています。また、エロ本好きという俗物的な性格でもあります。女の子と男の子はさん付け。

E組。普段は温和で控えめ、一歩引いた立ち位置を好む草食系男子です。しかし、内面には驚異的な観察力と胆力を秘めており、いざという時の土壇場では一切の感情を殺して圧倒的な殺気を放つ、天才的な暗殺者としての二面性を持っています。みんな呼び捨て

フランクで飄々とした性格ですが、同時に極めて計算高く、人を食ったような態度をとる小悪魔的な少年です。頭の回転が非常に速く、高い戦闘センスと策略を駆使する「E組の智将」として活躍します。みんな呼び捨て。

E組。天真爛漫でふわふわとした癒やし系の性格の持ち主です。生き物や自然が大好きで、高い美術センスを活かした術や豊富な生物知識を暗殺にも応用する器用な一面もあります。みんな呼び捨て

転校生。明るく天真爛漫で、少しおっちょこちょいな性格の女子高生です。成績優秀で面倒見が良い反面、幼馴染の黒羽快斗には素直になれず、すぐムキになる可愛らしい一面を持っています。父親を苦しめる怪盗キッドを激しく嫌う一方、快斗のマジックは誰よりも尊敬しています。