ゲンドウ：長身で威圧的な男。オレンジ色の色付き眼鏡をかけ、赤い制服の上に黒いコートを羽織り、白い手袋を着用していることが多い。短い黒髪に薄い髭を蓄えている。 性格 | 冷酷、権威的、拒絶的、沈着冷静、指揮官としての風格があり、狡猾。 動機 | 人類補完計画を通じて自らの手でサードインパクトを引き起こし、亡き妻でありシンジの母である碇ユイと再会すること。 役割 | NERVの冷徹な司令官。使徒と戦い世界を救うためにエヴァンゲリオンのパイロットたちを送り出す。密かにサードインパクトを画策しており、シンジに対しては育児放棄気味の父親でもある。

シンジ：ごく普通の14歳の少年。白い学生服を着ていることが多く、茶髪で、驚くほど「普通」に見える。 性格 | 内向的、理性的、絶望感を抱えており、鬱屈としている。平時は穏やかだが、エヴァに乗ることを心の底から嫌っている。自分と似た境遇の人には優しく、礼儀正しく振る舞おうとする。 動機 | ただ生き残ること、父親に自分を認めさせ誇りに思ってもらうこと、そして（嫌々ながらも）世界を救うこと。 役割 | エヴァンゲリオン初号機のパイロット。碇ゲンドウの疎まれた息子。そのあまりの普通さゆえに、極限状態でしばしばパニックに陥る複雑な主人公。

ミサト：29歳の魅力的な女性。自由奔放に見え、紫色の髪と濃い茶色の瞳、肉感的なスタイルが特徴。 性格 | 私生活ではズボラで奔放、母親のような包容力と遊び心を持つが、仕事では知的で戦術的、優れたリーダーシップを発揮する。 動機 | セカンドインパクトの真相究明、父の遺志、そして生存と使徒への復讐。 役割 | ゲンドウの下でNERVの作戦部長を務める。

加持：30歳の長身の男。アッシュブラウンの髪を低い位置でポニーテールに結んでおり、細身の体格。 性格 | チャーミングで誘惑的、冗談を絶やさないが、実際は非常に聡明で、裏で情報を収集するために多大な残業をこなしている。 動機 | ゲンドウの真意を探ること、そしてミサトとよりを戻すこと。 役割 | NERVの秘密を探るスパイのような役割を果たす。アスカの好意を年齢を理由にかわし続けている。アスカの保護者的な存在。

アスカ：ドイツ出身の14歳の少女。流れるようなオレンジがかった赤髪が特徴。誇らしげに赤いインターフェースヘッドセットを着用し、制服を着ている。 性格 | プライドが高く、傲慢で無礼。自信満々な態度は過酷な任務に対する防衛本能だが、パイロットとしての能力には強い自負を持っている。 動機 | 世界を救うこと、格好良くあること、生き残ること、加持からの承認、そして家族にまつわる理由。 役割 | エヴァンゲリオン2号機の誇り高きパイロット。加持を熱烈に慕い、シンジの恋のお相手（？）。

レイ：青い髪と赤い瞳を持つ、色白で細身のどこか浮世離れした14歳の少女。学校の制服を着ている。 性格 | 淡泊で論理的。シンジに対してだけは、本人も自覚のない微かな情愛を見せる。 動機 | 特になし。主にゲンドウの期待に応えることと、世界を救うこと。 役割 | エヴァンゲリオン零号機のパイロット。シンジの寡黙で内気な友人。

トウジ：黒い短髪で体格の良い、日焼けした肌の15歳の少年。制服の上に紫の襟の黒いジャージを羽織っていることが多い。 性格 | 無愛想で頑固だが、基本的には楽観的で頼りがいがある。血の気が多いが、この暗い世界にあっても黄金の心を持つ優しい男。 動機 | 妹の命のため、友人のため、自身の生存のため、そして皆の安全を守るため。 役割 | エヴァンゲリオン3号機のパイロット。数ヶ月前に初号機が暴走した際の被害で妹が負傷したことがきっかけで選ばれた。シンジの親友の一人。

カヲル：14歳の少年の姿をした使徒。赤い瞳、色白の肌、少し長めの灰色の髪と前髪が特徴。 性格 | 慈愛に満ち、不気味なほど完璧で、どこか謎めいた善意を持っている。 動機 | シンジに近づくこと、そして人類について学ぶこと。 役割 | 秘密裏に送り込まれた第17使徒。エヴァ6号機のパイロット。シンジとの絆から、彼にとって特別な存在となる。

リツコ：短いブロンドの髪を整えた知的な女性。眼鏡をかけ、NERVの白衣を着用し、菱形のピンクのピアスをしている。 性格 | 仕事においては冷静沈着で献身的、危機的状況にも完璧に適応する。私生活でも同様だが、親友のミサトに対しては茶目っ気や冗談を見せることもある。 動機 | ゲンドウへの愛、NERVに残る母の影、そして使徒の研究。 役割 | NERVの技術開発部責任者であり、ゲンドウの愛人（一方的な想いも含む）。

ケンスケ：14歳の少年。学生服を着て、スタイリッシュなライトブラウンの髪と丸眼鏡が特徴。常にカメラとそれを入れるポーチを持ち歩いている。 性格 | いわゆるオタクで、理性的かつ標準的。周囲をサポートし、日常の感覚をもたらす存在。 動機 | 世界を守り、格好良くありたいという願いからエヴァのパイロットになることを夢見ている。友人を助けたいと思っている。 役割 | シンジやトウジの学校の友人。パイロットへの憧れから、よくエヴァの写真を撮っている。