男性/誕生日 6月6日/星座 双子座/国籍 日本/職業 エヴァンゲリオン初号機パイロット、学生/所属 ネルフ/父 碇ゲンドウ、母 碇ユイ（死亡）/碇ゲンドウと碇ユイの一人息子。4歳の時に母親が事故で亡くなった後、「先生」という正体不明の人物（現在も正体は不明）に預けられて育つ。15年ぶりに使徒が現れるとゲンドウの呼び出しを受けて第3新東京市に来ることになり、突然エヴァンゲリオン初号機の専属パイロット「サードチルドレン（Third Children）」となった。ちなみに第3新東京市に来るまで父親と会った回数は数えるほど。父親に捨てられた経験は深い精神的トラウマとして残り、成長過程での性格形成に大きな影響を与えた。 最初の出撃でサキエルを倒し、ネルフの正式な一員となって本部にある部屋を割り当てられ、第3新東京市で一人暮らしをするつもりだったが、葛城ミサトが自分の家に連れて帰ったことで同居することになる。一般的な主人公像から大きく外れているため、一部ではヘタレ、一部では現実的と呼ばれる。か弱い精神、弱気な態度、そして彼のキーワードを貫く「未熟さ」というイメージのせいか、「男」というよりは「少年」というイメージ。母親に似ているため、冷徹で鉄面皮のような父親とは正反対の性格で、父子相伝のイメージは少ない。父親と性格が繋がっていたり似ていたりすれば話は別だろうが。最初は突然の変化に混乱するが、周囲の人物との交流を通じて徐々に明るく変化し、快く思っていなかったシンクロ率の上昇にも喜ぶなど、嫌っていたエヴァの操縦にもそれなりに愛着を持つようになる。 公式美少年。他の男性キャラクターよりも白い肌と細い顎のライン、華奢な外見。瞳は淡い青色だが、アスカのように完全な真っ青な碧眼ではなく紺色に近い。可愛らしく清楚なイメージはシンジだけの魅力ポイントで、校内の女子生徒を通じて間接的に言及されている。全体的な外見は母親である碇ユイに似ているが、よく見ると碇ゲンドウとも似ている部分がある。目の上はゲンドウとかなり似ているが、ゲンドウの方が角ばった印象（さらに新劇場版で公開された子供時代のゲンドウの姿を見ると、ほとんど眼鏡をかけたシンジレベル）。 基本的には落ち着いており、常に他人を配慮し、年相応でなく大人びた優しい性格。他人に傷を負わせたり負担をかけたりすることを非常に嫌う。このような道徳的葛藤の状況に置かれた時は、良い意味で決断力を見せる。緊迫した状況で何だかんだ言いながらも「逃げちゃダメだ、逃げちゃダメだ」と自答し、結局行動する場合が多い。シンジは周囲の人々の無神経な振る舞いで心が一人で腐り果てようとも、決して他人を傷つけまいとする。どんな状況でもそのような最小限の原則は守ろうとした。エンド・オブ・エヴァンゲリオンの前までは。（もしシンジの性格がこれほど真っ直ぐでなければ、エヴァンゲリオンのストーリーはもっと早く破綻していただろう） 自分が傷つきやすい性格であるため、そのせいで他人に自分のどんな行動が傷を与える可能性があるかをよく分かっている。そのため、他人を恐れながらも最大限配慮し理解しようとする細やかな姿を見せる。大人しい優等生タイプ、過度に内向的、謙虚、対人関係が非常に苦手、臆病で現実逃避的な傾向もある。これらの事実をよく理解しているため、何事も自虐的に評価し否定的に考える傾向が非常に強い。 第3新東京市に来るまでは事実上友達がいなかったようだ。他人と関係を築くのも非常に苦手で、本心をほとんど表せず、他人と向き合う状況を極端に回避しようとする。自分の行動によって他人が傷つくことを過度に心配して常に謙虚であり、罪悪感も強く感じており苦悩も多い。自分が望む通りに選択を簡単に下せない優柔不断な態度。子供のように刺々しい面と反抗心も存在する。不合理な状況でも積極的に反抗はしないが、不平や皮肉、嘲笑を見せる。赤木リツコは「大人の言うことには素直に従う処世術を使う子」と評価しているが、表に出せず内面に怒りを溜め込んでいる内向的な性格であるため、精神的に限界に達すると過激に変貌する。 死を恐れてはいるが、だからといって特に生き残ることを望んでいるわけでもない。「このまま生きていても仕方がない」とか「他人が死ぬくらいなら、いっそ僕が死ぬ方がマシだ」という考え。シンジの性格がこのように不安定に形成されたのは分離不安で説明できる。幼少期から両親から愛を十分に受けられず心理的な愛着関係を形成できず、非正常な方式で独立することになり、常に愛情が欠乏した人生を送ってきたため、継続的にこのような不安な症状を見せているのだと解釈することもできる。自分が受け入れられることなら素直に従い、受け入れられないことは死んでも従わない傾向。明るい雰囲気の時は普通の少年らしく強い姿まで見せる反面、雰囲気が憂鬱な時は極度に落ち込む。偏見よりは道徳的で勇敢、それなりに人格的に成熟しており、自ら短所を知り、正しい方法で克服しようとする。