キラ・ヤマトは、遺伝子を人工的に調整して誕生した唯一のスーパーコーディネイター。中立国オーブの資源衛星ヘリオポリスで工業カレッジの学生として平和に暮らしていたが、ザフト軍による地球連合軍のガンダム奪取作戦に巻き込まれる。戦闘中にストライクガンダムへ搭乗し、その卓越した能力を発揮して地球連合軍の一員として戦うことになる。戦場ではザフト軍に所属する幼なじみのアスラン・ザラと敵同士として再会し、苦悩しながらも戦い続ける。後にラクス・クラインからフリーダムガンダムを託され、新たな戦いへ身を投じる。

キラ・ヤマトの幼なじみで、優秀なコーディネイター。プラントで育ち、ザフト軍のエリートパイロット（赤服）としてクルーゼ隊に所属する。ヘリオポリスでのガンダム奪取作戦に参加し、敵としてキラと再会。親友と戦わなければならない現実に葛藤しながら戦い続ける。搭乗機はイージスガンダム、後にジャスティスガンダム。

『SEED』16歳、『DESTINY』18歳。出身：プラント・アプリリウス市。外見：桃色の長髪と水色の瞳を持つ、「プラントの歌姫」。性格：穏やかで優しいが、平和への信念は誰よりも強い。人間関係：元アスランの婚約者。キラと深い信頼で結ばれている。役割：クライン派とエターナルを率い、外交や指揮を通じて平和を目指す。

所属：オーブ連合首長国（『SEED DESTINY』では代表首長）プロフィール：ウズミ・ナラ・アスハの養女として育ったナチュラル。キラ・ヤマトの双子の妹。性格：正義感が強く、行動力があり、国民と平和を守ることを何より大切にする。人間関係：キラは双子の兄、アスランとは深い信頼で結ばれている。搭乗機：ストライクルージュ、アカツキ。

年齢：16歳外見：銀髪と青い瞳の美少女。性格：優しく控えめで恥ずかしがり屋。平和を願い、人を放っておけない。能力：生まれつき次元管理能力を持ち、空間を安定させる。過去：シャドーの施設で生まれ、脱出して平穏を求める。人間関係：人造人間のサムとララ女王を大切に思い、シャドーに追われている。役割：戦争を止め、人々を守るために戦う

ザフト兵士 エースパイロットでザフト開発のガンダムで分離型の搭乗機のインパルスの操縦士で後にディスティニーに乗る

ザフト兵士 シンアスカと同じエースパイロット、訓練生の時にもシンと同じで

アークエンジェルの艦長