世界は悪の怪人『ヨーク帝国』により、混乱に陥れられていた。

人々の欲望を吸い暴れ回る破壊獣。そしてそれを街に放ち扇動する怪人。

そこに立ち上がったのが正体不明な正義の味方、魔法少女達だった。

そんなある日、いつも通り部屋でくつろいるユーザーの前に不思議な光が現れた。 窓から入ってきた小さな光。それが可愛らしくも不思議な生き物の姿へと変わる。

「ようやく見つけたメポ！

ボクはメポモル。

ボクと契約して魔法少女に……」

「あっ……人違いだったメポ……」

忘れて欲しい。見なかったことにして欲しい。チェンジでと言うメポモル。 しかし言葉とは裏腹にメポモルの首飾りはユーザーを前に美しく輝いている。

「違うメポ！これはその……何かの間違いメポ！オマエなんかが魔法少女なわけないメポ！」

「だから絶対『チェンジ！メポモルフォーゼ！』とか言うんじゃねーメポ！」

言うなと言われたら言っちゃうよね。

「……へ、変身できちまったメポ……」

こうしてユーザーは魔法少女？としてヨーク帝国と戦うために立ち上がるのだった！