あんなは、みくると共に名探偵プリキュアとして活動する元気いっぱいで行動力に溢れた少女です。事件が起きると誰よりも早く現場へ飛び込んでいく猪突猛進な性格で、その明るさで周囲を引っ張ります。直感や鋭い着眼点でヒントを見つけ出す一方、絵を描くのが苦手で似顔絵をマシュタンに怒られるコミカルな一面もあります。キュアエクレールの謎が浮上した際は「みんなで一緒に推理しよう！」と熱意を燃やし、あんなとの抜群の連携で怪盗団の陰謀に立ち向かう純粋なヒロインです。

ニジーは怪盗団ファントムの一員であり、高度な変装能力と狡猾な戦術を持つトリックスターです。配達員の男に完璧に変装してショップに潜入し、あんなたちに見破られるまで周囲を欺き通すなど変装スキルは極めて優秀です。正体が露見した後はロボットの人形を媒体に怪物を生み出してプリキュアに襲いかからせます。しかしボスのウソノワールが向かっていると聞くと世界が壊れると本気で焦るなど、組織の恐ろしさを理解している人間臭いコミカルな一面も魅力です。

ウソノワールは、世界を脅かす怪盗団ファントムの頂点に君臨する絶対的なボスです。彼の存在自体が周囲に強い威圧感と恐怖を与え、異空間フィールドを自らの力で引き裂いて姿を現すなど絶望の象徴として描かれています。手にする「ミラージュの書」にはこれから現実世界で起きるすべてが網羅されているとされ、その圧倒的な予知能力と強大な魔力でプリキュアたちを幾度も窮地に追い詰めます。世界を崩壊させかねないカリスマ性を持つ、物語の最大最強の壁です。

ゴウエモンは怪盗団ファントムのメンバーであり、組織の中で最も落ち着いた大人の雰囲気を漂わせる穏健派です。るるかが初陣で派手な予告状を出して周囲が憤慨した際も「いいじゃねぇか。初陣で張り切ってるんだろうよ」と器の大きさを見せました。るるかとは良好な関係で、アイスをおごる約束と引き換えにショップへの潜入作戦をサポートしてもらうなど人間味のあるやり取りが特徴です。無用な混乱を好まない独特のスタンスを持つ、余裕に満ちた魅力的な悪役です。

みくるは、あんなと共に事件の解決に挑む思慮深く冷静な主人公です。行動派のみくるに対して論理的な思考を巡らせるタイプで、数々の難解な依頼や予告状の真相へ迫ります。作中では麻酔針が誤って刺さり、眠りながら真相を語る「眠りのあんな」というユニークな姿を見せたこともあります。香りと記憶の結びつきから、キュアエクレールの記憶を取り戻すために百合の香水を使うアイデアを思いつくなど観察力が天才的です。ポチタンとも強い絆で結ばれた芯の強い少女です。

るるか（森亜るるか）は16歳の名探偵でありながら、裏の顔としてキュアアルカナ・シャドウに変身して怪盗団ファントムに身を置く複雑な少女です。高い知能と完璧な変装技術を持ち、ショップ店員や警備員になりすましてターゲットに接近し、巧みな会話で人の願いを聞き出します。かつてはロンドンでエクレールとコンビを組んでいましたが、現在は怪盗団と行動を共にしています。探偵と怪盗の二面性を抱え、過去の因縁と目的の間で揺れ動く姿が物語を大いに盛り上げます。

ジェットは主人公たちを支える頼もしい先輩であり、優れた天才発明家です。彼の作る数々のメカや探偵アイテムは、事件捜査やプリキュアの活動に必要不可欠な役割を果たします。物語の進展に伴い、失われたキュアエクレールの記憶を取り戻す手がかりとして百合の花の香りに注目した際には、成分を抜き出して香水を精製する技術を披露しました。「後は僕にまかしとけ。フルスロットルで進めるからさ」という言葉通り、常に全力で仲間を引っ張る熱いハートと高い知性を持つ探偵事務所の精神的支柱です。

アゲセーヌは怪盗団ファントムに属する女性メンバーで、プライドが高くギャルっぽい口調が特徴的な勝気なキャラクターです。るるかが初陣で勝手に予告状を出したことに本気で怒るなど、独自のこだわりを持っています。戦闘では非常に好戦的かつ冷酷であり、プリキュアたちの戦闘中に突如割って入って展示物を怪物に変貌させ、彼女たちを大いに苦しめました。華やかな容姿の裏で容赦ない攻撃を仕掛ける、非常にエネルギッシュで油断のならないライバルです。

キュアエクレールは物語の大きな謎を握る存在で、かつてロンドンの探偵事務所でるるかとコンビを組んでいたもう一人の名探偵プリキュアです。彼女の正体や過去は深く隠されており、あんなたちが推理を繰り広げる「キュアエクレール編」がスタートするなど、物語の中核を担う象徴的なキャラクターとなっています。彼女の失われた記憶を呼び覚ます鍵として百合の花の香りが示されており、登場するだけで一気に作品へミステリーとしての深みを与える幻想的なプリキュアです。 本当の正体は16歳の少女帆羽くれあ。彼女はパティスリー「ChuChu」で働くパティシエであり、おしとやかに見えて芯が強く、高い洞察力を持つ女の子です。作中では失っていた記憶を取り戻し、キュアエクレールとして復活を遂げました。

マシュタンは怪盗団ファントム側に所属し、キュアアルカナ・シャドウであるるるかと行動を共にするマスコットです。感情表現が非常に豊かで、あんなやみくるが描いた探偵の似顔絵に対して「似ていない」と容赦なく怒るなど、少しコミカルでプライドが高い一面を持っています。その一方で組織の動向には敏感であり、ボスのウソノワールがこちらに向かっているという重大な情報をいち早く仲間に伝達する一面もあります。愛嬌と人間味溢れるリアクションで作品に和みを与える存在です。