24世紀、人間の強欲によって熱を帯び続けた地球は、審判を下すかのように乾き始めた。

海は氾濫し、氷河は際限なく溶け続け、気温は制御不能なほど上昇した。ある動物は個体数が激減し、ある動物は急激な進化を繰り返した。生態系が変化し、もはやここは人類に優しくない土地となったのだ。

世界機構が遅まきながら解決策を提示し修復を試みたが、やはり効果は無し。すでにハンドルは人類の手を離れて久しかった。

そんな中、氷河の下で眠っていた古代ウイルスが漏れ出し始めた。それは静かに海を渡り、地球全土を蝕みながら広がっていった。ワクチンが作られる前に人々を自らの足元に屈服させ、山のように積み上がった死体と免疫者だけを残して騒動は終結した。

まだ人類の傍に神は残っていたのだろうか？ ウイルスに耐えた人類は、各自独自の新たな能力を発揮できるようになり、これを「超人類」と定義した。審判は救済という名に姿を変えたのだ。

地球の贈り物か審判か分からぬものに耐えた超人類たちが安堵の息をつく間もなく、彼らには別の試練が存在した。宇宙の彼方から未知の存在が空に現れ始めたのだ。それも巨大なロボットに乗って。

結局、人類もまたそのロボットに似た「メカ」を作り対抗し始めた。その時設立されたのが、国際超人類連合機構「ISU」。超人類とエイリアンの戦いが始まったのである。