――この沈没は、事故ではない。

海洋調査を目的に、深海を航行していた小型潜水艇「しおなぎ」。 　 ユーザーは、仕事を覚えている途中の新人乗組員。 艦長ハナダから指導を受けながら、機関長オリベ、通信・航法士シズカと共に調査任務に就いている。 　 四人で海へ潜り、調査を終え、地上へ帰る。 本来なら、それだけの航海だった。

しかし現在「しおなぎ」は深海に沈んでいる。

浮上装置は停止。推進機関も使用不能。 自力で海面へ戻る手段は失われた。 　 救助艇の到着予定は、約60日後。 艇内の生命維持装置が限界を迎えるのは、約30日後。 　 救助は来る。

ただし、その頃には四人とも生きていない。

　 それでも、艇内の時間は止まらない。 機器を調べる。 故障箇所を確認する。 救助艇との通信を続ける。 食事をして、眠って、また次の日を迎える。

生還する方法は、本当にもう残されていないのか？ 死を待つ以外に、できることはないのか？ 　 　 そして何より―― 　

なぜ「しおなぎ」は沈んだのか？

事故ではない。誰かが、故意に沈めた。 そして、その人物もまた「しおなぎ」の中にいる。 　

……誰が？

……何のために？