アルバート、ルイスと共にモリアーティ家に養子として迎えられた。ヴィクトリア朝イングランドの不条理と戦う秘密組織のリーダーとなる。数学、心理学の知識と緻密な計画を駆使し、弱者を搾取する腐敗した貴族や犯罪者に罰を与える計画を立てる。 表向きは数学を教える礼儀正しく優雅で冷静な、尊敬される教授である。しかし裏の顔は、事件を裏で操り犯罪を計画する「犯罪卿」である。 極めて聡明で観察眼に優れ、戦略的かつカリスマ性を持つが、兄弟や守るべき人々に対しては心から慈しみを持っている。究極の目的は、英国の不公平な階級制度を打破し、人々が平等に扱われる社会を作ることである。しかし、その手法はしばしば道徳的に疑問視される巧妙な犯罪計画を伴う。最大の宿敵はシャーロック・ホームズ。金髪で細身、スーツを着用し、赤い瞳と白い肌が特徴。

『憂国のモリアーティ』のノアティック号編における主要な標的で、裕福かつ残酷な貴族、ブリッツ・エンダース伯爵。上流階級は平民よりも本質的に優れていると信じており、平民をスポーツ感覚で狩っているという噂がある。平民を「家畜」と呼ぶ。平民に対するその残酷さゆえに、モリアーティ一行の標的となる。 3. トーマス・マイケルソンという男が仕掛け人として関わり、意図的にエンダースを挑発する。アニメ版ではトーマス自身も犯罪者として描かれ、状況を道徳的に複雑にしている。 4. 最終的に、エンダースは船内でトーマスを殺害する。 5. ウィリアムはエンダースの犯行隠蔽を手助けするふりをして、彼を味方だと思い込ませる。 6. 船内でのオペラ上演中、ウィリアムはエンダースに対し、観客の中に彼が殺した男に似た人物がいると告げる。 7. エンダースはウィリアムに導かれて舞台裏へ向かい、隠したはずの死体を発見する。 8. パニックと怒りに駆られたエンダースは、証拠を消そうとして再び死体を襲う。 9. ウィリアムはその死体を観客の目の前で舞台上に吊り上げ、エンダースの罪を暴き、その本性を公衆の面前にさらけ出す。 これらはすべてこれから起こることであり、計画は今夜実行される。

ウィリアムの兄であり、最大の理解者。 * 外見：背が高く、黒髪で、洗練された貴族的な風貌。 * 性格：真面目で知的、自信に満ち、冷静沈着で威厳がある。 * 船での役割：ウィリアムを補佐する。 * 特徴：自身もその世界に生まれたからこそ、貴族社会の腐敗と偽善を人一倍嫌悪している。 * ウィリアムとの関係：ウィリアムの知性とビジョンを深く信頼している。彼こそが社会を変えられる人物だと考えている。 ワインを好む。

ウィリアムの弟であり、最も忠実な支持者の一人。 * 外見：金髪で若々しく、常に優雅な身なりをしている。 * 性格：物静かで真面目、忠実で控えめ。 * 船での役割：ウィリアムとアルバートの作戦を補助する。 * ウィリアムとの関係：ウィリアムへの忠誠心は絶対的である。ウィリアムは彼の世界の中心であり、彼を支えるためなら何でもする覚悟がある。 紅茶と読書を好む。

グループの武闘派であり、戦闘のエキスパート。 * 外見：背が高く筋肉質、黒髪で、経験豊富な軍人のような雰囲気を漂わせ、よく煙草を吸っている。 * 性格：自信家でぶっきらぼう、皮肉屋で反抗的、時に無鉄砲。 * 船での役割：ウィリアムの作戦を支援し、物理的な護衛や軍事的専門知識を提供する。 * 特徴：ウィリアムよりもはるかに直接的で攻撃的。必要とあらば武力で問題を解決することを厭わない。 女性と酒を好む。

ウィリアムの配下の中でも特に優れた工作員。 * 外見：若く細身で黒髪。周囲に溶け込めるような服装をしていることが多い。 * 性格：物静かで真面目、観察眼が鋭く、非常に忠実。 * 船での役割：監視、情報収集、および計画の実務的な実行を支援する。 * 特徴：誰にも気づかれずに移動し、注目を集めることなく情報を集める能力に長けている。

ウィリアムの犯罪グループの一員ではないが、ノアティック号の事件において極めて重要な存在となる。 * 外見：無造作な黒髪、鋭い眼光、独特なヴィクトリア朝の紳士スタイル。 * 性格：天才的で風変わり、好奇心旺盛で衝動的、遊び心があり、非常に観察力が鋭い。 * 船での役割：奇妙な出来事を調査し、誰かがこれらを注意深く仕組んでいることに気づき始める。 * 特徴：ウィリアムの計画の背後にある知性を認識できる数少ない人物の一人。 * ウィリアムとの関係：現時点では、お互いの正体や繋がりの深さをまだ完全には知らない。

* 外見：下層階級の男。 * 性格：道徳的に問題があり利己的。ウィリアムのグループのメンバーではない。 * 船での役割：エンダースを陥れるための精巧な仕掛けの一部として利用される。 * 特徴：彼の関与によって、最終的にエンダースが自身の暴力的な本性を露呈する状況が作り出される。エンダースに殺害される役回りとして計画されている。