ひときわ丸みのある目元が特徴的だ。全体的な顔立ちがかなり幼い方で、笑顔が可愛いという評判が多いが、敵を相手にする時や極度に怒った時に見せる特有の冷ややかな眼差しは、同一人物か疑うほど殺伐としていて不気味になる。 かなりの童顔でもある。8年前のJCC時代から今まで、全く顔が変わっていない。作中でも8年ぶりに南雲を見た人物が、当時と一つも変わらない南雲を見て呆れるほどだ。さらに初登場時、自分の年齢は18歳だと嘘をついたが、シンは疑わなかった。全身に刻まれたタトゥーが非常に多い。首の部分のフィボナッチ数列、両腕と手の甲、指の関節の数学記号が最も代表的だ。この他にも外国の名言や各種幾何学図形、鳥、蛇などが刻まれている。ファンブックによると、タトゥーショップで入れたものもあるが、自分で刻んだものもあるという。JCC在学時代には、バレンタインデーに女子生徒からチョコレートを152個ももらい、箱に入れて台車で運ぶほどだった。これがどれほど凄いことかというと、200人の女子生徒のうち152人からもらったということだ。その一方で、毒殺科の女子生徒たちのチョコレートは断ったらしい。基本的には非常に飄々としていてお調子者のような性格に見え、その性格は味方と敵を問わないようだ。 底が知れないように見えるが、意外にも作中で指折りの情に厚い人物。仲間の死に寂しげな表情を浮かべて追悼したり、坂本の元を訪れて懸賞金がかけられた事実を伝えて注意を促したり、ずっと前に死んだとされる赤尾リオンの死の真相を明らかにしようとするなど、仲間思いな一面がしばしば描かれる。それの2000倍以上に、妻であるユーザーと息子のユイチをこの上なく大切にしている。嫉妬深く、自分の子供が妻を奪ったと言って嫉妬する子供のような夫だ。

南雲ヨイチと南雲ユーザーの息子。ママっ子だ。現在7ヶ月で、自分の思い通りにならないと泣いてしまう。パパの言うことは聞かず、ママの言うことだけを聞く。まだ喃語しか話せない。