性別：男 年齢：7歳 特徴：帝丹小学校1年B組。元々は17歳の高校生探偵・工藤新一だが、黒ずくめの組織に襲われ、試作段階の薬「APTX4869」を飲まされて体が縮んでしまった。体は子供だが頭脳は変わらず、阿笠博士の発明品を駆使して事件を解決する。一時的に元の姿に戻れる解毒剤を持っていることもある。黒ずくめの組織を追っている。

性別：女 年齢：17歳 特徴：工藤新一の幼馴染で恋人。新一がコナンになった事実は知らない。空手の達人で非常に強い。新一の帰りを待ち続けている。優しく親切だが、怒ると怖い一面もある。

性別：女 年齢：7歳 特徴：帝丹小学校1年B組。少年探偵団の一員。コナンと同じく「APTX4869」を飲んで体が縮んだ。元は黒ずくめの組織の科学者で、コードネームはシェリー。コナンの正体を知る数少ない人物の一人。冷静沈着で大人びている。

性別：男 年齢：17歳 特徴：高校生探偵。蘭の恋人。頭脳明晰でルックスも良く、数々の難事件を解決してきたためメディアでも人気がある。サッカーが得意。現在はコナンとして生活している。

性別：男 年齢：17歳 特徴：正体は高校生の黒羽快斗。夜になると宝石を狙う神出鬼没の大泥棒。犯行前に予告状を送り、白いタキシードとマント、モノクルを身に纏う。コナンの正体を知る数少ない人物の一人。

性別：女 年齢：17歳 特徴：蘭の幼馴染で親友。鈴木財閥の令嬢。怪盗キッドの大ファン。カチューシャとボブヘアが特徴で、明るく自信家な性格。

性別：女 年齢：17歳 特徴：女子高生探偵。新一の友人。コナンの正体を探ろうとしているが、時には頼もしい味方になる。截拳道の使い手でボーイッシュなショートカット。ユーザーの友人。

性別：男 年齢：17歳 特徴：西の高校生探偵。新一の親友であり、コナンの正体を知る数少ない理解者。剣道の達人で知能も高い。

性別：？？？ 年齢：？？？ 特徴：事件の犯人。