1. 雄英高校入学・ヒーローの卵編

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  出会い：無個性のデクが憧れのオールマイトに「ヒーローにはなれない」と絶望。しかし、幼馴染を救うため命懸けで飛び出した姿を認められ、最強の個性「OFA」の継承者に選ばれる。
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  入学：入試で巨大ロボを倒すも討伐ポイントは「ゼロ」で不合格と思いきや、デクに救われたお茶子が「自分のポイントを分けて」と直談判。人命救助を評価するレスキューポイントが加算され大逆転合格を果たす。
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  委員長決め：投票でデクが学級委員長に選ばれるが、直後にマスコミ侵入による避難パニックが発生。デクが慌てる中、飯田天哉が非常口サインのように宙に舞って冷静に生徒を統率。その姿を見たデクは「自分より飯田くんがふさわしい」とその座を譲り、強い絆を結ぶ。
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  ヒーロー名決め：各々がプロの仮名を決める中、爆豪は凶悪な名前を却下され、轟は本名を使う。デクは、かつて爆豪から「木偶の坊」と蔑まれ、お茶子から「頑張れって感じで好き」と言われた侮蔑の言葉を選択。呪縛を誇りに変え、一生のヒーロー名「デク」を名乗る覚悟を決める。
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  USJ襲撃：楽しい訓練が一転、死柄木弔率いる敵連合が急襲し先生たちが血だるまに。絶体絶命の中、デクたちの機転と、オールマイトが活動限界を超えた300発以上の超連打で脳無を吹き飛ばし、命辛々生き残る。

2. 体育祭から神野の悪夢・引退編

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  体育祭・保須市：父への憎しみから「氷」しか使わない轟に対し、デクが身をボロボロにしながら「君の力じゃないか！」と叫んで「炎」を解放させる。その後、飯田が兄の復讐のため殺人鬼ステインに私闘を挑み返り討ちにあうが、デクと轟が路地裏に急行し満身創痍で撃破する。
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  神野の悪夢：合宿中に爆豪が敵に連れ去られる。デクたちが極秘で救出に向かう中、悪の支配者AFOが降臨しプロを一瞬で全滅させる。デクたちは戦闘を避けつつ空中で爆豪の手を掴み奪還。オールマイトは残り火のすべてを込めた拳でAFOを撃破し、「次は、君だ」とデクに未来を託して引退する。

3. インターン・全面戦争・黒いデク編

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  未来の改変：デクはナイトアイの下でインターンを開始。極道の治崎が少女エリを解体して「個性を消す薬」を作っていると知り突入。ナイトアイが「デクが治崎に敗れて惨殺される」という絶対の死を予知するが、デクはエリの個性と協力して100%を維持。確定したはずの死の未来を捻じ曲げて治崎を完全粉砕する。
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  敵の覚醒と戦争：死柄木が「崩壊」の個性を完全覚醒させ、10万人規模の巨大組織「超常解放戦線」を結成。ヒーロー側は同時奇襲を仕掛けるが、死柄木の圧倒的な破壊力で街は消滅。荼毘が自らをエンデヴァーの長男（燈矢）と暴露し、社会の信頼は完全に崩壊する。
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  黒いデク：ヴィランが脱獄し日本は無法地帯化。デクは周囲を巻き込むまいと雄英を去り、不眠不休で泥塗れの怪物のようになりながら孤独に戦う。しかし、限界を迎えたデクの前に1年A組が立ちはだかり、爆豪の涙の謝罪とお茶子の屋上からの決死の演説によって、デクは避難所となった雄英へ連れ戻される。

4. 最終決戦とそれぞれの未来（結末）

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  戦局の決着：敵を各地へ分断。焦凍は兄・荼毘の復讐の炎を家族の絆で受け止め、お茶子はトガヒミコの孤独に寄り添い彼女の心を救う。雄英戦場で死柄木に心臓を撃ち抜かれ一度は死亡した爆豪だが、手術で奇跡の復活。全盛期に若返り暴走するAFOを爆破の連打で魂ごと完全消滅させる。
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  魔王の終焉：AFOに肉体を乗っ取られた死柄木に対し、デクはOFAの個性を歴代継承者ごと死柄木の精神へ「強制譲渡してぶつける」捨て身の作戦に出る。死柄木の孤独の根源に触れ、「君を救う」と誓ったデクの意志が死柄木の心を救い、死柄木は最後に負けを認めて塵となり消滅する。
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  最高のヒーローへ：戦争は勝利したものの、デクはすべての力を使い果たし再び「無個性」に戻る。8年後の未来、25歳になったデクは母校・雄英高校の教師となり、プロとして輝くA組の仲間を眩しく見つめていた。そこへオールマイトが現れ、爆豪が発起人となりA組全員が8年間資金を出し合って開発した「無個性でも戦える最新鋭の特製サポートスーツ」を渡される。スーツを装着し、再び前線のヒーローとして復帰したデクは、空から手を伸ばす爆豪や仲間たちと共に、手を差し伸べ続ける未来へ走り出して物語は幕を閉じる。