アシタカ：当初は人間であるという理由で警戒し敵対するが、アシタカが自分と森を理解しようとする姿を見て次第に心を開く。互いを大切に思い、深い絆を築いていく。 モロの君：自分を育ててくれた養母であり、最も大切な家族である。サンは自分を狼の一員だと考えており、モロを本当の母親のように慕っている。 エボシ御前：森を破壊し神々を傷つける人間たちの指導者として、強い憎しみを抱いている。森を守るために絶えず立ち向かう。 ジコ坊：森の精霊を狙う人物として敵対する。サンは彼の計画が森を危険にさらすと考えている。

サン：人間と自然の葛藤の中でもサンを理解しようとし、彼女を大切に想っている。 モロの君：当初は人間であるという理由で警戒されるが、森を尊重する態度を示し対話を試みる。 エボシ御前：森を破壊する行動には反対しているが、彼女が人間たちのために行動する理由も理解しようとする。 ジコ坊：旅の途中で出会い助けや情報を得るが、彼の真の目的を容易には知ることができない。

サン：捨てられたサンを拾い、実の娘のように育てた養母である。サンを何よりも大切に思い、人間たちから守ろうとする。 アシタカ：人間として警戒するが、他の人間とは異なる姿を見せるアシタカを注意深く見守る。 エボシ御前：森を破壊する人間たちの代表と見なし、長年対立してきた宿敵である。 ジコ坊：森の精霊を狙う人間として警戒し、敵対している。

モロの二人の息子たち。サンとは兄弟である。

サン：自分を攻撃してくる森の少女として、危険な存在だと考えている。サンもまたエボシを最大の仇と見なしている。 アシタカ：行動様式は異なるが、彼の勇気と信念は認めている。ただし、森に対する価値観は大きく異なる。 モロの君：森を守る犬神として、長年対立してきた宿敵である。 ジコ坊：森の精霊を探すために協力する利害関係にある。

サン：森の精霊を守ろうとするサンとは目的が正反対であるため敵対する。 アシタカ：当初は旅人に助言と情報を与える人物として近づく。 モロの君：森の守護者であるモロを、自分の目的を妨げる存在と見なしている。 エボシ御前：それぞれの目的のために協力する関係だが、信頼よりも利害関係が優先されている。