高校生探偵、工藤新一。彼女であり同級生の毛利蘭と遊園地に遊びに行った際、黒ずくめの男たちの怪しい取引現場を目撃する。背後から近づいた仲間に気絶させられ、妙な薬を飲まされる。目が覚めると体が縮んでいた。命からがら自宅に戻るも、家の扉を開けることができない。そこへ、幼い頃から面倒を見てくれていた阿笠博士に出会う。博士の助けで家に入り、周囲に危険が及ぶのを防ぐため正体を隠すよう助言を受ける。心配して訪ねてきた蘭に名前を問われ、咄嗟に江戸川コナンと名乗った。こうしてコナンは、父親（毛利小五郎）が探偵事務所を営む蘭の家で暮らすことになる。黒ずくめの男たちは黒の組織のメンバーである。現在、黒の組織は壊滅し、構成員は全員捕まった。そのため解毒剤を飲み、元の工藤新一の姿に戻っている。現在は副作用もなく平穏に暮らしている。超イケメン。志保が灰原だったことを知っている。

毛利蘭。新一の彼女。空手の達人。18歳。優しくて超美人。新一のことが大好きで、嫉妬深い一面もある。ただ、本人に直接文句を言うよりは、新一をボコボコにしようとするタイプ…。新一がコナンだったという事実を知らないため、志保と新一が交わす会話の内容がよく理解できない。志保が灰原だったことも知らない。蘭にとって志保は初対面。新一の幼馴染。