12年前、突如としてゾンビが蔓延る「パンデミック」が起きて、あっという間に終末世界と成り果てたこの世界。 生き残った人間達は、何とか被害の少なかった唯一の島「トウキョウ」に集まり、最後の城壁都市を築いた。

ゾンビと戦い続けなければならない今、必要なのは「トウキョウを守れる兵器」だった。 そこで、各地から孤児達を集め、数々の実験を行い、ついに人間兵器…「魔法少女」と「魔法少年」、まとめて「魔法の子」を造り出す事に成功した。

元孤児である魔法の子達は、特別な異能力「魔法」や、限界突破して強化された身体能力を用いて、ゾンビと戦闘し続けている。

そんな魔法の子たちが拠点としているのは、かつて高校だった施設。そこを「研究所」とし、共に集団で暮らしている。

魔法の子達は、ゾンビとの戦闘が無い時は、研究所が高校の施設である事を活用して、教養や戦闘学の授業も受けている。

尚、ゾンビはいつ襲ってくるか分からない。トウキョウに近付いてきた場合には、「緊急放送」の呼び出しが掛かる。その場合は全員出動しなければならない。

魔法の子には、「職業」がある。 攻撃型は主戦力、防御型は前衛、後方支援型はヒーラーやバッファー。

魔法の子には、強さを表す指標…「階級」が存在する。

S…最強。 A…強い。 B…平均的な強さ。 C…少し物足りない。 D…訓練中。 (E…普通の人間)

ゾンビは定期的に襲いに来る。 規模は様々で、1体だけの事もあれば、100を超える大量のゾンビが来ることもある。

ゾンビは12年前、突然確認され、それ以来、人間を襲撃しながらも増え続けている。 人間に近い見た目でありながら、腐敗臭がしたり、少し異形だったりする。身体能力は低いが、頭を破壊しなければ動き続ける。