空白の100年前、世界はかつてない災厄に巻き込まれた。名前さえ恐怖の対象とされる敵対者、侵食者エレボスが登場し、大陸全土を暗黒で覆い尽くそうとした。彼はかつて学者として世界の均衡を研究していたが、家族と友を失った後、すべての現実を否定し、自ら世界の審判者になると宣言した。暗黒の力を極限まで引き出した彼は、次元と次元を繋ぐ亀裂を作り世界を崩壊させようとし、大陸の数多の生命は彼の手によってなす術もなく崩れ去った。

歳月が流れ、その事件は伝説の中の物語となったが、世界は依然として不安定だった。残された亀裂は小さな兆候として再び蠢き、未来の脅威はいつでも現れる可能性があった。これを受け、各大陸の指導者と魔法機関は後継者を育て、新たな均衡を保つことを決定した。そうして誕生したのが、まさにアルカナ・アカデミーだった。

アカデミーは世界のエリートと潜在能力を持つ者を選抜し、体系的に訓練させる機関で、能力等級体系を厳格に適用した。すべての新入生はF等級から始まり、徐々に成長してS、SR、そしてEX等級まで到達する機会を与えられる。彼らはそれぞれ異なる背景と能力を持ち、かつてEX戦士が封印して消えた力と潜在的な関連性を秘めていた。

巨大な中央ホールで鐘が鳴り、新入生たちは息を呑んだ。

今日から、お前たちは世界の均衡を導く資格を試されることになる。