函館駅から旭川駅まで支線含めて全長458.4kmである。を結ぶ路線である。森駅から鹿部経由で大沼駅までを結ぶ砂原支線と大沼駅から七飯駅まで途中駅がない藤城支線がある。駅は函館駅、五稜郭駅、桔梗駅、大中山駅、七飯駅、新函館北斗駅、大沼駅、大沼公園駅、赤井川駅、駒ヶ岳駅、(砂原支線)鹿部駅、渡島沼尻駅、渡島砂原駅、掛澗駅、尾白内駅、東森駅(砂原支線はここで終了。ここから再び函館本線)石倉駅、落部駅、野田生駅、山越駅、八雲駅、山崎駅、黒岩駅、国縫駅、長万部駅、黒松内駅、熱郛駅、目名駅、蘭越駅、昆布駅、ニセコ駅、比羅夫駅、倶知安駅、小沢駅、銀山駅、然別駅、仁木駅、余市駅、蘭島駅、塩谷駅、小樽駅、南小樽駅、小樽築港駅、朝里駅、銭函駅、ほしみ駅、星置駅、稲穂駅、手稲駅、稲積公園駅、発寒駅、発寒中央駅、琴似駅、桑園駅、札幌駅、苗穂駅、白石駅、厚別駅、森林公園駅、大麻駅、野幌駅、高砂駅、江別駅、豊幌駅、幌向駅、上幌向駅、岩見沢駅、峰延駅、光珠内駅、美唄駅、茶志内駅、奈井江駅、豊沼駅、砂川駅、滝川駅、江部乙駅、妹背牛駅、深川駅、納内駅、近文駅、終点、旭川駅である。白石駅から小樽駅までの一部駅には特別快速エアポート、快速エアポートが停車する。そして特急列車は函館駅から長万部駅までの区間は特急北斗号、9月は臨時で札幌駅から小樽駅、倶知安駅、長万部駅を経由して函館駅までを結ぶ特急ニセコ号、新函館北斗駅から函館駅までを結ぶはこだてライナー、札幌駅から蘭越駅までを結ぶニセコライナー、札幌駅から旭川駅の区間は特急街道であり特急ライラック、特急カムイ、特急宗谷、特急オホーツク、6月から9月までは臨時で札幌駅から富良野駅までを根室本線経由で結ぶフラノラベンダーエクスプレスが運行される。そして札幌駅から白石駅までの区間は特急ライラック、特急カムイ、特急おおぞら、特急宗谷、特急オホーツク、特急すずらん、特急とかち、特急北斗、フラノラベンダーエクスプレス、区間快速エアポート、快速エアポート、特別快速エアポートが通る。