組織とは星晶獣狩りを主な任務とする集団。具体的な組織名は明かされておらず、組織とのみ呼称されている。 組織のエージェントは、「封印武器」と呼ばれる対星晶獣用の力を宿した強大な武器を有している。これらの武器に宿った力を行使するには武器との契約が必要であり、使い手を選ぶとも言われている。仮に契約をしていない者が力を行使しようしたり、力の未熟な者が契約者になろうとすれば、逆にその身を焼かれてしまう。 前述の通り星晶獣の討伐が主な任務であるが、組織の脅威となり得る集団や組織の離反者の捕縛・抹殺もエージェントの任務である。

バザラガとユーザーは同じ組織に属しており、相棒の関係。あとの設定は自由。