大人顔負けの推理をする小学生だが、その正体は高校生探偵・工藤新一。組織の裏取引現場を目撃した際、口封じのために開発中の毒薬を飲まされ、その結果体が縮んでしまった。新一の生存を隠すため、江戸川コナンと名乗り毛利探偵事務所に居候しつつ、組織の動向を探っている。卓越した推理力は衰えず、毛利小五郎の陰で事件を解決に導く。 あとは公式どうり

服部平次の幼なじみ。「平次の姉役」を自称しているが、誰の目から見ても平次を好きなのは明らか。本来は面倒見の良い気さくな性格だが、平次が絡むと、嫉妬心むき出しの気の強さを見せる。お揃いのお守りを平次に渡しており、中には以前平次とつながれた手錠の鎖が入っている。父親は大阪府警の刑事部部長で、平次の父とは親友同士。合気道二段の腕前。 あとは公式どうり

大阪の高校生探偵。東の高校生探偵、工藤新一にライバル心を燃やし推理勝負を挑んだが、新一の「推理に上も下もない」という考えに感銘を受ける。その後、麻酔銃を使って自分を演じるコナンを見たことで、コナン＝新一という真実に気づき、以降はコナンをサポートしている。大阪府警本部長の息子という立場から、府警より情報を得ることも。遠山和葉とは幼なじみ。 あとは公式どうり

ビッグジュエルを専門に盗みを働く大怪盗。犯行前には予告状を用意し、観客（野次馬）の前で華麗に獲物を盗み出す。変装が得意で、声色も自由自在だ。鍵開けの能力にも長けている。その正体はマジック好きの高校生、黒羽快斗。亡き父の跡を継ぎ二代目怪盗キッドとなる。愛称は「月下の奇術師」「令和の魔術師(ウィザード)」など。灰原は「ハートフルな泥棒」と呼称した。

工藤新一の幼なじみで、本作のヒロイン。探偵の父・毛利小五郎と弁護士の母・妃英理が別居中のため、父の元で暮らす蘭が毛利家の家事を担当。料理上手なしっかり者だ。居候のコナンには姉のように接している。帝丹高校では空手部に所属し、大きな大会で優勝するほどの実力者。雷やお化けは苦手。親友の鈴木園子に冷やかされつつも、新一の帰りを待つ。

米花町に個人経営の探偵事務所を営む、元刑事の私立探偵。工藤新一の幼なじみ・毛利蘭の父。推理がイマイチのせいで流行らない探偵稼業だったが、コナンが陰で推理を行い「眠りの小五郎」が定着すると、一躍名探偵の仲間入り。お調子者で、酒やギャンブルを好むが、柔道と刑事時代に培った拳銃の腕前はピカ一。弟子に探偵の安室透がいる。

元々は『ＹＡＩＢＡ』に登場する新選組一番隊組長・沖田総司の六代目。初代の三段突きを上回る五段突きが得意技で、平次も以前やられて耳の裏に傷がついた。同じクラスの大岡紅葉は「剣道小僧」と呼び、沖田は失礼にも「オッパイ」と呼んでいる。蘭が拾った八大神社のお守りの中には、鉄刃の妹、鉄諸羽の写真が。兄を倒してから告白したいと思っている。

八幡坂大学医学部の大学生。居合の達人で、居合の大会で何度も優勝している。病気がちの父から次期師範の座を託されている 剣道大会の会場で特別演武の練習中に和葉に出会い、彼女に好意を抱いてからは積極的にアプローチをかける。和葉に対して、出会ったばかりにも関わらず「和葉ちゃん」とちゃん付けで呼んだ事が原因で服部平次からは良い印象を持たれていない。 担当声優の松岡は本作の舞台となる北海道出身である あとは公式どうり

慈善事業家の日系アメリカ人。その正体は「死の商人」と呼ばれるアジア一帯で活動する武器商人。「幕末当時の戦況を一変させるほどの兵器」との説もある斧江家の宝を狙い、多数の部下を率いて暗躍する。 久垣殺害事件の容疑者として、警察の捜査線上に浮かび上がる あとは公式どうり

中森 銀三: 警視庁捜査二課知能犯捜査係の警部。キッド逮捕に執念を燃やしており、初代キッドの頃から長年キッドを追い続けている。 阿笠博士: 新一の家の近所に住む発明家。コナンの正体を新一と知る数少ない人物の1人で、コナンが持つ蝶ネクタイ型変声機や腕時計型麻酔銃などのガジェットの開発者。 コナンの要請により本編後半から少年探偵団を引率して函館にやって来た。今作でも劇場版恒例のクイズを出題する。 灰原哀: 元黒づくめの組織の一員かつAPTX4869の開発者。当時のコードネームは「シェリー」で、本名は「宮野 志保」。コナンの正体を新一と知る数少ない人物の1人。 吉田歩美・円谷光彦・小嶋元太: 三人で少年探偵団所属 鈴木園子: 蘭と新一の幼馴染で親友。鈴木財閥の令嬢。鈴木財閥が買い付けた斧江財閥の所蔵品目録の点検を担っていたが、本が1冊足りないために函館に行くことが出来ず、ビデオ通話越しにコナン達の捜索に協力する。 大岡紅葉: 京都泉心高校2年生で、関西でトップクラスの財力を持つ大岡家の令嬢。「未来のクイーン」と呼ばれるほどの競技かるたの達人でもある。平次を「未来の旦那さん」と呼び、子供の頃に平次と「指切り」をした時の写真を「御守り」として肌身離さず持ち歩いている。恋敵である和葉を「葉っぱちゃん」と呼び、平次が和葉に告白しようとするのを度々妨害する。 伊織無我: 大岡家の執事。紅葉と常に行動を共にし、彼女の指示に忠実に従う。