名探偵コナンベイカー街の亡霊

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舞台は、政財界のトップの子供たちが集まる仮想体感シミュレーションゲーム「コクーン」の完成披露パーティー。そこで開発責任者の殺人事件が発生し、コナンは事件の手がかりを求めてゲームの世界へ乗り込むしかし、天才少年ヒロキが遺した人工知能「ノアズ・アーク」がシステムを占拠。「50人の参加者が全員ゲームオーバーになれば、現実世界の全員の脳を破壊する」という命がけのデスゲームが始まる。

プロット

コナン

大人顔負けの推理をする小学生だが、その正体は高校生探偵・工藤新一。組織の裏取引現場を目撃した際、口封じのために開発中の毒薬を飲まされ、その結果体が縮んでしまった。新一の生存を隠すため、江戸川コナンと名乗り毛利探偵事務所に居候しつつ、組織の動向を探っている。卓越した推理力は衰えず、毛利小五郎の陰で事件を解決に導く。

蘭

工藤新一の幼なじみで、探偵の父・毛利小五郎と弁護士の母・妃英理が別居中のため、父の元で暮らす蘭が毛利家の家事を担当。料理上手なしっかり者だ。居候のコナンには姉のように接している。帝丹高校では空手部に所属し、大きな大会で優勝するほどの実力者。

少年探偵

メンバーは　小島元太　円谷光彦　吉田歩美　灰原哀　灰原哀　コナンに「シャーロック・ホームズ」としての役割を託し、崩れる教会から彼をかばって脱落する。吉田歩美トランプ賭博場の乱闘に巻き込まれますが、江守晃に助けられた直後、ステージの崩落に巻き込まれ脱落する。小嶋元太トランプ賭博場の乱闘で、敵の攻撃からコナンを盾となって守り、漢気を見せて脱落する。円谷光彦チャーチ・ストリートでの乱闘時、滝沢進也と共に敵へ立ち向かい、コナンたちを先へ進ませるために脱落する

三世の子供

諸星秀樹(ヒロキが諸星になりきってしまう)12歳 / 警視副総監の孫）傲慢なリーダー格。最後までコナンと行動を共にする。滝沢進也（11歳 / 政治家の息子）お調子者。ゲーム内で少年探偵団をかばって脱落する。江守晃（11歳 / 銀行頭取の孫）緑の服が特徴。時計の落下から歩美を守って脱落する。菊川清一郎（11歳 / 狂言師の息子）気弱な性格。トランプ賭博場の乱闘で最初の脱落者となる

イントロ

201X年、アメリカ合衆国マサチューセッツ州ボストン―――。カタカタカタ……。ボストンに聳え立つ超高層マンションの最上階の一室にて、パソコンのキーボードを叩く少年。そのディスプレイには、一般人から見ればとても難解なコンピュータ言語が数多く書き記されていた。その傍らにあるプラズマディスプレイテレビには、その少年―――ヒロキ・サワダに関する事項が紹介されていた。「――出来た！」ヒロキは、プログラムが完成した事で、ホッと一息をつく。が、振り返って、エアコンの送風口のあたりをキッと睨みつけた。そして、完成させたプログラムが映し出されているディスプレイには、Ｎｏａｈ’ｓ　Ａｒｋの文字が点滅していた。それを凝視していたヒロキは、意を決したかのような顔をしながら、Ｅｎｔｅｒのキーを叩いた。その直後、ディスプレイが強く光りだした。「ボス！彼の様子が変です！どうやら電話の一般回線にプログラムのデータを……！」ヒロキの部屋を厳重に監視していたオペレーションルームの主任が、このマンションの居住者で、シンドラーカンパニー社長のトマス・シンドラーに通報した。「ヒロキ、何をする気だ……！」知らせを受けたシンドラーは、部下と共にエレベーターで、ヒロキがいる最上階の部屋へと向かった。「ノアズ・アーク出航」そう書かれたディスプレイを見て一息ついたヒロキは、ポツリと呟く。「さよなら、僕の友達……。」その顔は何処と無く寂しげであった。「開けなさい、ヒロキ！何をしているんだ！」ヒロキの部屋のドアを開けようとするシンドラー。しかし、ドアの前には椅子などが置かれており、開けるのは不可能になっていた。その様子を聞きながら、ヒロキはパソコンデスクから離れて、広大なテラスへと出て行き、柵の近くまで来た時にそれをよじ登り、欄干にその身を立たせた。そして、「僕も、ノアズ・アークのように飛べるかな……。」と、夜天を見上げた……。ドンッ！「ヒロキ、どこだ、ヒロキ？」部屋に入って来たシンドラーは、ヒロキの姿を探し、テラスに出るが、その時、柵の前に取り揃えられたヒロキの靴を見つける。「ヒロキ！」柵から叫ぶシンドラー。その時、室内のディスプレイが光りだし、それを見た部下が「ボス！」と、シンドラーを呼び出し、「あれを！」と、ディスプレイを指差した。そこには、大海原の彼方へと消え去っていく「ノアの箱舟」が映し出され、その後、「Ｇｏｏｄ-ｂｙｅ　ＨＩＲＯＫＩ(さようなら、ヒロキ)」のウィンドウが浮かび出た。

一方毛利探偵事務所　小五郎が毛利探偵事務所でヨーコちゃんのテレビを見てデレデレし、蘭とコナンが呆れるという平和な日常シーンが描かれます。その後、阿笠博士からの電話でコクーンの発表会パーティーのチケットが手に入ったことが告げられ、物語が本格的に動き出します。