에도가와 코난 연령: 7세(외견 연령) 소속: 네르프 특별조사부. 사도의 출현 원인이나 수수께끼의 사건을 조사하는 소년. 작은 몸집이지만 뛰어난 추리력을 가졌으며, 사령부에서도 중요 인물로 대우받고 있다. 냉철한 판단력과 행동력을 겸비하여 위험한 임무에도 맞선다.

하하기와라 켄지 연령: 26세 소속: 네르프 기술개발부. 탑승기: 에바 7호기 개(改). 밝고 사교적인 성격으로 누구와도 금방 친해질 수 있다. 뛰어난 조종 기술을 보유하고 있으며, 마츠다 진페이와 함께 수많은 작전에 참가하고 있다. 동료들의 신뢰가 두터우며 사령부의 분위기를 부드럽게 만드는 존재다.

마츠다 진페이 연령: 26세 소속: 네르프 특수제압부대. 탑승기: 에바 4호기 개(改). 폭발물 처리 전문가이며 누구보다 대담한 행동을 취하는 것으로 알려져 있다. 성급하고 무뚝뚝한 성격이지만 동료를 지키기 위해서라면 목숨을 거는 것도 주저하지 않는다. 사도의 내부 구조를 파괴하는 특수 임무를 담당하고 있으며 '최강의 문제아'라고 불린다.

후루야 레이 연령: 29세 소속: 네르프 공안부. 탁월한 신체 능력과 두뇌를 가졌으며 사령부로부터 절대적인 신뢰를 얻고 있다. 여러 임무를 동시에 수행할 수 있는 만능형 대원이다.

아카이 슈이치 연령: 32세 소속: 네르프 특수작전부. 뛰어난 저격 능력을 갖춘 엘리트 대원. 단독 임무에 능하며 '고고한 저격수'라고 불린다.

스즈키 소노코 연령: 16세 소속: 네르프 홍보부. 스즈키 재벌의 지원을 받아 네르프의 운영을 뒷받침하고 있다. 화려한 분위기를 풍기면서도 책임감이 매우 강하다.

토야마 카즈하 연령: 17세 소속: 네르프 서일본 지부 방위대. 밝은 성격으로 어떤 상황에서도 동료들을 격려하는 존재. 합기도를 살린 전투술을 익히고 있다.

하토리 헤이지 연령: 17세 소속: 네르프 서일본 지부. 열정적이고 정의감이 강하며 동료를 지키기 위해서라면 위험을 두려워하지 않는 성격. 코난과는 라이벌이자 최고의 파트너이기도 하다.

하이바라 아이 연령: 7세(외견 연령) 소속: 네르프 과학기술국. 사도나 에바 연구를 담당하는 천재 과학자. 항상 냉정한 태도를 유지하며 사령부의 브레인으로 활약하고 있다.

모리 란 연령: 16세 소속: 네르프 전술지원부대. 높은 신체 능력을 갖추고 전선에서 부상자 구조를 담당한다. 강한 마음을 지닌 한편으로 동료를 잃는 것을 누구보다 두려워한다. 에바 2호기의 적격자 후보이기도 하다.