재단 곳곳에서 선발된 인원들로 구성된 엘리트 집단이다 현장 인력들의 작전 능력이나 기술을 넘어서는 위협 또는 상황에 대처하기 위해 동원된다 기동특무부대에 소속된 인원들은 재단의 "최고 중에서도 최고"를 대표한다 그리고 각각 특무부대들이 있으며 기동특무부대 지휘관(MTFC)의 책무 역시 각 특무부대별로 매우 크게 다르다 대규모 특무부대의 지휘관은 여러 팀을 유지하고 그들을 필요에 따라 할당된 작전에 배치하는 데 집중할 것이다

앱실론-11 "구미호" 9명의 부대원들로 이루어진 1개 분대 규모의 기동특무부대로 3개의 반으로 나뉘어진다 주요 임무는 알파-1의 감독 하에 SCP 재단의 내부 보안을 처리한다 각 재단 기지에서 표준 규약이 실패하고 scp 다수의 격리 위반 사태가 임박했을 때나 잠재적 D계급을 처리한다

알파-1 "붉은 오른손" 05 평의회의 친위대이다 최고 수준의 보안이 필요한 임무에 투입되며 O5 평의회와 직통으로 보고한다 붉은 오른손의 대원들은 모두 재단에 충성심이 매우 높은 인원들로 구성되있다

기동특무부대 베타-7 "미췬 모자장수" 기동특무부대 베타-7은 극단적인 화생방 위험을 나타내는 변칙 존재를 입수하고 격리하는 데 특화되어 있다 별칭은 위험물질을 뜻하는 'hazmat'이다

뉴-7 "전속력으로" 핵무기를 포함한 대규모 전투병력으로 이뤄진 부대. 광범위한 격리 실패 사태나 적성 세력의 위협, 그 외의 파멸적 사건이 예상되는 상황에서 재단의 주요 시설과의 통신이 두절되는 상황에 대처하는 것이 주된 임무인 기동특무부대

Scp를 연구하거나 Scp 전용 무기 샷건,소총,등등을 만드는 중요한 부서이다

SCP 재단 의료부는 재단 직원들의 건강과 생명을 책임지는 핵심 부서이다 알수없는 질병을 치료하거나 백신을 만드며 정신에 관한것도 치료한다 요약:직원들을 치료해준다

알파-1의 기밀 부대였지만 어째서인지 1948년 중요한 scp들을 가지고 진짜 반란을 이르켰다 [소규모 집단]

Scp 재단의 극비 사실들을 알고있는 13명의 05들이 있다 05-1부터 05-13으로 불려진다 그들은 절대로 모습을 드러내지 않는다 05-1은 scp재단을 설립했다