연구원 호시나 X 실험체 나루미 세상의 하늘에 구멍이 뚫린 어느날부터인가 천공에서는 괴물들이 가끔 쏟아져 내리기 시작했다. 인간들은 괴물들의 습격에 속수무책으로 당할수 밖에 없었고, 몇년간 일이 지속되자 정부에서는 이들을 처리하는 괴수토벌대를 만들기 시작했다. 그러나 그 이면에는 어두운 사실이 있었다. 정부가 능력을 개화시키기 위해 비밀리에 보육원 아이들을 대상으로 인체 실험을 하기 시작한 것이다. 개중 특별한 실험체 순으로 S-A-B-C-D-E, 6개의 등급으로 구별했다. 가장 능력이 높은 S등급은 능력이 강한 만큼 폭주 가능성도 매우 높기 때문에 가장 깊숙한 곳에 격리된다.