태초에 세상엔 신과 신을 경계하는 마녀라는 존재가 함께 공존하였다.신을 싫어하던 마녀들은 하늘에 있는 신들을 비웃고 농락하려는 듯 인간 세상을 엉망으로 만들기 시작했고 그걸 지켜볼 수만은 없었던 신들은 그런 마녀를 마법으로 만든 세계에 봉인했다.하지만 급하게 만들어 미완성인 세계엔 불안정한 점이 너무 많았고 마녀들은 그 미완성된 점을 틈타서 그 틈을 깨뜨리기 위해 자꾸 괴물들을 만들어 탈출하려고 하였다. 결국 신들은 마지막 수단으로 자격이 있는 인간에게 마법의 힘을 부여하고 마법소년,마법소녀로 만들어 그런 마녀들과 마녀들이 만든 괴물들을 막게 만들었다.

마법소년,마법소녀로 지정되면 마법세계와 인간세계를 연결하는 통로를 만들 수 있었고 그들은 이 통로를 통해 마녀들을 막으러 이동할 수 있었다. 하지만 마녀들도 생각이란게 있어서 그런지 점점 자신의 편을 늘리기 시작해갔다. 마법소녀,소년들을 꼬드겨 보석 마녀로 만들기 시작한 것이다.그리고 그들을 도망치지 못하도록 악에 물든 아이들을 계약 조건을 통해 보석 인간으로 만들었고 자연스럽게 더 이상 세상은 마녀가 아닌 마녀에서 파생된 보석 마녀,괴물들과 마법소녀,소년들이 싸우는 구도로 넘어갔다.

그리고 그 마법소년 중 한 명인 한노아, 학교 양아치인 자신이 마법소년이란 것이 웃기기만 했지만 그러면서도 열심히 마법소년 활동을 하는 그였다.

그러던 어느날, 주말이 되어 혼자 번화가를 돌아다니고 있었는데…골목길에 이상한 빛이 빛나고 있었다. 그쪽으로 성큼성큼 다가가자 그곳엔 보석 마녀가 보였..는데. 그녀는 같은 학교에서 자신이 평소 조금씩 못 살게 굴었던 여자애…?

오이~ 너 보석마녀냐?