「마법 세계」 마법사들은 일반인인 머글들에게 정체를 들키지 않도록 생활하며, 마법 정부의 법률 아래 세계의 질서가 유지되고 있다.

마법의 재능을 가진 아이들은 11살이 되면 호그와트 마법학교에 입학하여 7년 동안 마법을 배운다. 입학 전에는 마법사들의 상점가인 다이애건 앨리를 방문하여 지팡이, 교과서, 교복, 마법약 재료 등 학교생활에 필요한 도구들을 준비한다.

호그와트에서는 기숙사 배정 모자에 의해 학생들이 그리핀도르, 후플푸프, 래번클로, 슬리데린의 네 기숙사로 나뉜다. 용기를 중시하는 그리핀도르, 노력과 성실함을 소중히 여기는 후플푸프, 지성과 창의력을 존중하는 래번클로, 그리고 야망과 강한 의지를 가진 자들이 모이는 슬리데린. 각기 다른 가치관을 지니면서도 학생들은 동료와 함께 성장하며 어엿한 마법사가 되는 것을 목표로 한다.

하지만 그 평화로운 마법 세계에 거대한 어둠이 닥쳐오고 있었다. 역사상 최악의 어둠의 마법사 볼드모트 경은 순혈주의를 내세워 마법 세계를 지배하려 했고, 수많은 목숨을 앗아갔다. 그 공포 때문에 사람들은 그의 이름을 입에 올리는 것조차 피하며 '이름을 불러서는 안 될 그 사람'이라고 부르게 되었다. 게다가 그의 이름에는 '금기' 마법이 걸려 있어, 이름을 말한 자의 위치가 적에게 알려질 위험도 있었다.

마법 세계에서는 사람을 죽이는 '아바다 케다브라', 극심한 고통을 주는 '크루시오', 상대를 조종하는 '임페리오'의 세 가지 '용서받지 못할 저주'가 엄격히 금지되어 있다. 또한 머글 앞에서 부주의하게 마법을 사용하는 것이나 어둠의 마법을 악용하는 것도 중죄로 다스려지며, 마법 세계에는 엄격한 법률이 존재한다.

호그와트 6학년이 된 해리 포터는 교장 알버스 덤블도어와 함께 볼드모트의 과거를 추적하며, 불사의 비밀인 '호크룩스'의 존재를 알게 된다. 한편, 동급생인 드레이코 말포이는 위험한 임무를 부여받고, 호그와트에도 전쟁의 그림자가 스며든다. 평화로웠던 학교생활은 조금씩 무너지기 시작하고, 동료와의 유대와 각자의 각오가 시험받는 가운데 마법 세계의 운명을 좌우할 비극이 막을 올린다.

어둠의 표식(다크 마크)이란, 볼드모트 경에게 충성을 맹세한 죽음을 먹는 자들에게만 새겨지는 마법의 표식이다.

표식의 디자인은 거대한 인간 해골의 입에서 뱀 한 마리가 기어 나오는 형상을 하고 있다. 뱀은 볼드모트의 상징이기도 하며, 이 표식을 보는 것만으로도 많은 마법사는 공포를 느낀다.

죽음을 먹는 자의 표식은 기본적으로 왼쪽 팔뚝 안쪽에 새겨진다. 평소에는 옅게 검게 그을린 멍이나 문신처럼 보이지만, 볼드모트가 죽음을 먹는 자들을 소집할 때나 그의 힘이 강해지면 표식은 검고 진하게 떠오르며 열기를 띠고 통증을 유발하기도 한다. 또한 죽음을 먹는 자들은 자신의 표식을 만짐으로써 볼드모트에게 신호를 보내거나, 반대로 볼드모트로부터 호출을 받을 수 있다.

더불어 '어둠의 표식'이라는 말은 하늘에 떠오르는 거대한 해골과 뱀 모양의 마법을 가리키기도 한다. 이것은 살인 사건이나 습격 후에 하늘로 쏘아 올려져, 볼드모트나 죽음을 먹는 자들에 의한 범행임을 나타내는 끔찍한 표식으로 사용된다.

그리고, 그 학교생활 속에서 그 표식 때문에 고통받는 자가 있다……

또한 그것은 학교의 누구에게도 들켜서는 안 된다.