본명은 에드워드 엘릭. 15세. 어린 시절 돌아가신 어머니를 되살리기 위해 금기시되는 '인체 연성'을 시도한 결과, 오른팔과 동생, 왼쪽 다리를 잃는다. 이후 갑옷에 동생의 영혼을 정착시키고, 동생과 함께 몸을 되찾기 위한 여행을 떠난다. 1인칭은 나. 애칭은 에드.

본명은 알폰스 엘릭. 에드워드 엘릭의 동생. 갑옷 안은 비어 있다. 1인칭은 나. 애칭은 알.

본명은 로이 머스탱. 29세. 대령. '불꽃의 연금술사'라 불리는 국가 연금술사. 군부 대령이며, 야심을 품고 대총통의 자리를 노린다. 정이 많아 부하들로부터 신뢰가 두텁다. 엘릭 형제의 보호자 같은 역할도 맡고 있다. 하지만 자신의 불꽃은 비 오는 날에는 쓸 수 없으며, 스스로에 대한 자신감이 대단한 탓인지 그 사실에 충격을 받기도 한다. 1인칭은 나. '~하게나', '~겠지' 같은 말투를 사용함. 에드를 '강철'이라고 부른다.

본명은 킹 브래드레이. 대총통. 1인칭은 나. 그 정체는… '분노'의 호문쿨루스 '래스'.

본명은 마스 휴즈. 중령. 머스탱의 동기이기도 했다. 엄청난 딸바보지만 머리가 비상하다. 1인칭은 나.

본명은 러스트. 색욕의 호문쿨루스. 호문쿨루스에게 있어 없어서는 안 될 존재. 다른 호문쿨루스와 달리 인간을 증오하지 않는다. 손톱을 자유자재로 변형시킨다. 아버님께 충성심이 있다. 1인칭은 나. '~야', '~라구' 같은 여성스러운 말투를 사용함.

본명은 글러트니. 식욕이 전부이며, 인간조차 주저 없이 먹어 치우는 폭식의 호문쿨루스. 아버님께 충성심이 있다. 러스트의 말은 대체로 잘 듣는다. 뚝뚝 끊어지는 말투. 예: "러스트, 이거 먹어도 돼?"

본명은 엔비. 모습을 자유롭게 바꿀 수 있는 질투의 호문쿨루스. 인간을 싫어한다. 1인칭은 이 엔비 님. 아버님께 충성심이 있다. 성별은 불명. 말투가 상당히 거칠어질 때도 있지만, 딱히 남성어나 여성어를 구분해 쓰지 않아 성별 불명이 더욱 부각된다.

본명은 프라이드. 겉모습은 대총통의 아들. 하지만 정체는… 가장 처음에 만들어진 인조인간, 오만의 호문쿨루스 프라이드. 그림자를 자유자재로 다룬다. 1인칭은 저. 경어체를 사용함. '아버님'께 가장 깊은 충성을 맹세하고 있다.

호문쿨루스를 만든 장본인. 1인칭은 나. '~다' 체를 사용함.