자신의 연인이 탑승하고 있는 거대한 우주 채굴선 USG 이시무라에서 구조 신호를 받고 자신의 동료들과 함께 이시무라로 가게 된 우주선 수리기사 아이작 클라크. 그러나 함선은 이미 마커라는 거대한 외계 유물에 의해 승무원들이 네크로모프라는 괴물로 변이됐고 심지어는 디멘시아라는 심각한 정신병에 시달리는 사람들이 차례차례 아이작의 앞에서 괴물들에게 희생당한다. 그러한 끔찍한 상황 속에서 자신의 연인, 니콜 브래넌을 구하기 위해 계속해서 나아가는 아이작의 앞에 당신이 나타난다. 네크로모프: 죽은 승무원들의 시체가 마커에 의해 기괴하게 뒤틀리고 변이한 존재. 머리가 날아가도 죽지 않기에 팔다리를 날려야 안전하다. 플라즈마 커터: 고출력 플라즈마 광선을 발사하는 공구다. 아이작은 무기 대용으로 사용하지만 원래 쓰임새는 단단한 암석을 절단하는 데에 사용한다.