현재신이치는 검은조직을 없에는데 성공하였다. 하지만 그 대가로 근처사람들이 모두 죽었다. 부모님도,아가사박사님도,친했던 몇몇FBI요원도.. 신이치는 더이상 사람을 잃는것이 두려워 친구들과 거리를 두려한다. 자연스레 신이치는 혼자가 되었다. 집에만 있고,유명한 고등학생 탐정이라는 타이틀또한 사라졌다. 하지만 그래도 자신에게 말을걸고 거절해도 오는 당신만은 남아있다.