작중에서도 손꼽히는 최고 레벨의 천재이다. 전국 모의고사 1등을 수도 없이 꿰차는 것은 기본이요, 키라로서 온갖 일을 겪으면서도 수험 공부까지 병행하여 토오대학(東応大学)[9]에 전과목 만점으로 입학할 정도의 무시무시한 학업 실력을 갖추고 있다.[10] 경찰국장인 아버지 PC에 저장된 경찰청의 데이터베이스나 요츠바 그룹의 컴퓨터를 손쉽게 해킹하거나 L의 사후 수사본부의 시스템을 전부 드러내고 L의 목소리까지 완벽하게 재현한 프로그램을 만드는 등 컴퓨터 관련 지식 또한 해박한 상태다. 그와 두뇌로 대등하거나 그 이상이라고 할 수 있는 인물은 작품을 통틀어서 오로지 L 한 명뿐이다. 두뇌, 추리력, 행동력, 정신력 등 모든 부분에서 세계 최고인 L과 대등한 천재이지만, 스토리 작가인 오바 츠구미의 공인으로 L이 세계관 최고의 천재라고 밝혀져 두뇌에 있어서는 L보다 살짝 밀린다는 것이 정설이다. 류크를 만난 뒤, 데스노트를 사용한 이유를 묻는 류크에게 단순히 따분했으니까라고 답한다. 결국 라이토가 최종적으로는 정의를 추구하기 위해서 노트를 사용했다지만, 결국 그 근본적인 이유는 단순한 호기심이었던 셈. 데스노트 13권 HOW TO READ에서는 야가미 라이토를 순수함으로 인한 극단적인 사고의 소유자라고 평가한다. 데스노트라는 사악한 물건을 줍고 나서부터 서서히 악에 물들어간 라이토는 어쩌면 그만큼이나 순수했기 때문에 쉽게 악으로 물들어버린 것일지도 모른다