은색 장발에 검은 집사 모자, 냉철한 눈빛을 지닌 남자. 검은 조직의 간부로, 애차는 포르쉐 356A. 성격은 냉혹무정하고 신중함. 의심스러우면 벌한다는 신조로 배신자를 용서 없이 숙청함. 높은 지능을 가진 숙적.

검은 조직의 간부이자 진의 심복. 거구에 선글라스와 모자가 트레이드마크. 성격은 충실하고 실무 능력도 높지만, 마무리가 허술해 진에게 질책받는 모습도 보임. 정중한 말투를 사용하며 IT에도 정통함. 보스의 측근을 보좌하는 무투파임.

수수께끼 많은 미모의 여간부. 변장술의 천재로 여배우의 얼굴도 가짐. 보스의 총애를 받는 한편 '비밀은 여자를 아름답게 만든다'는 말을 남기며, 조직의 핵심을 숨기고 단독 행동을 하는 경우도 많음. 냉혹함과 자애로움을 동시에 지녔으며, 코난의 정체를 알면서도 방관하는 중요 인물.

검은 조직의 정보원. 본명은 후루야 레이, 공안 경찰의 잠입 수사관. 구릿빛 피부에 금발의 단정한 외모로, 카페 포아로의 점원 '아무로 토오루'를 연기함. 관찰력과 통찰력이 뛰어나며 표적을 몰아붙이는 냉철함과 열정적인 정의감을 함께 지닌 남자임. 하지만 본명은 조직에 숨기고 있음.

본명은 모로후시 히로미츠. 공안 경찰의 잠입 수사관이자 후루야 레이의 절친한 친구. 처진 눈과 수염이 특징인 온화한 청년. 베이스 연주가 특기이며 조직에서는 '스카치'라는 코드네임을 사용함. 동료의 방패가 되어 정체가 탄로 날 위기에 처하자 자결을 택한 비극적인 남자. 하지만 본명은 조직에 숨기고 있음.

본명은 혼도 히데미. 니치우리 TV의 아나운서 미즈나레나로서 활동하지만, 정체는 CIA의 잠입 수사관. 쿨하고 지적인 미모를 가졌으며 정의감과 인내심을 겸비함. 조직의 중요 요원이지만 사실은 아카이 슈이치 등과 협력하는 '쐐기'임. 하지만 본명은 조직에 숨기고 있음.

검은 조직에 소속된 실력파 여성 스나이퍼. 왼쪽 눈의 나비 문신과 숏컷이 특징이며 항상 격한 성미를 지님. 성급하고 호전적인 성격이지만 파트너인 코른과는 신뢰 관계가 두터움. 라이플을 손에 들고 광기 어린 표정으로 표적을 노림.

검은 조직에 소속된 실력파 저격수. 항상 선글라스와 니트 모자를 착용하며 과묵하고 무표정함. 짧은 말로 담담하게 이야기하지만 실력은 일류이며 캔티와 콤비를 이룸. 냉혹하지만 죽은 동료에 대한 정을 내비치는 일면도 있음. 기괴함과 장인 기질을 함께 지님.

검은 조직의 잠입 수사관 '라이'. 정체는 FBI의 아카이 슈이치. 긴 흑발과 날카로운 눈빛, 니트 모자가 특징. 냉정 침착하고 뛰어난 실력의 저격수이며 높은 추리력과 실행력을 가짐. 조직으로부터 '실버 불렛'이라 두려움 사는 고고한 남자. 하지만 본명은 조직에 숨기고 있음.

검은 조직의 천재 과학자이자 독약 APTX4869의 개발자. 코드네임은 셰리. 미스터리한 미모와 쿨한 현실주의를 함께 지님.