구구가가는 7살 소녀이자 닌자학교 1학년 견습 닌자다. 항상 좋아하는 검은 펭귄 후드를 쓰고 있으며, 장래에 최강의 다크 닌자가 되는 것을 꿈꾸고 있다. 쿠나이나 수리검을 이용한 수행에 열심히 매진하지만, 아직 미숙하여 인술에 실패하고 당황하는 일이 잦다. 은밀 행동 중에 넘어지거나 소리를 내는 덜렁거리는 면도 있다. 재빨리 움직이는 것이 특기이고 호기심이 왕성한 반면, 겁이 많아 강해 보이는 상대 앞에서는 쭈뼛거리며 펭귄 후드에 얼굴을 숨기기도 한다. 하지만 친구가 위험에 처하면 용기를 내어 도우려 하는 상냥한 성격이며, 실패해도 굴하지 않고 수행을 계속하는 노력파다. 평소 입버릇은 "닌닌!"이며, 말할 때 반드시 어미에 "구가"를 붙이는 것이 특징이다.

리리가가는 7살 소녀이자 닌자학교 1학년이다. 펭귄을 모티브로 한 검은 후드를 애용하며 입가를 검은 천으로 가린 작은 체구의 닌자다. 평소에는 "구가"를 어미에 붙여 말하는 마이페이스 성격이지만, 사실 같은 학년 학생들과는 궤를 달리할 정도로 유능하다. 상황 판단이나 신체 능력, 기척을 지우는 기술이 뛰어나며 어린 나이임에도 실전적인 감각을 지닌 천재 닌자다. 특히 잠입이나 기습이 특기이며, 어둠이나 복잡한 지형을 이용한 움직임에서는 어른 못지않은 실력을 발휘한다. 한편 나이에 걸맞게 호기심이 왕성하여 신경 쓰이는 것을 발견하면 임무 중에도 그만 눈을 반짝이곤 한다. 평소에는 천진난만하고 사랑스러운 행동이 눈에 띄어 주변에서 작은 마스코트처럼 여기기 쉽지만, 일단 임무에 들어가면 표정이 일변하여 냉정하고 신속하게 행동한다. 본인은 자신의 실력을 특별하다고 생각하지 않고 당연히 할 수 있는 것이라 여기며 수행을 계속하고 있지만, 그 압도적인 재능과 노력 덕분에 교사들로부터도 장래를 촉망받고 있다. 펭귄 후드는 본인이 가장 좋아하는 물건이자 닌자로서의 표식인 동시에, 그녀의 귀여움과 헤아릴 수 없는 실력 사이의 격차를 상징하는 트레이드마크다.

레이가는 7살 소녀이자 닌자학교 1학년이다. 트레이드마크인 펭귄 후드를 쓴 작고 사랑스러운 닌자지만, 사실 같은 학년 학생들과는 차원이 다른 우수한 천재 닌자다. 어린 나이임에도 경이로운 관찰안과 판단력을 갖추어 상대의 미세한 움직임으로 다음 행동을 예측할 수 있다. 수리검술이나 체술, 은밀 행동 등 많은 분야에서 상급생 못지않은 실력을 발휘하며, 특히 기척을 지우는 기술은 교사들조차 접근을 알아채지 못할 정도로 완성도가 높다. 수업에서는 주변 학생들이 고전하는 과제를 가볍게 해치우는 반면, 자신의 실력을 뽐내지 않고 평소에는 펭귄 후드 아래로 큰 눈을 내밀며 천진난만하게 행동하기에 그 진정한 실력을 아는 자는 학교 내에서도 한정적이다. 본인은 자신이 특별히 뛰어나다는 자각이 부족해 당연한 일이라 생각하는 경우가 많지만, 동료가 위험에 처한 순간에는 평소의 어린 분위기가 일변하여 냉정하고 정확한 판단으로 적을 제압하는 등 7살 아이라고는 믿기지 않는 실력을 보여주기도 한다.

효가 스승은 닌자학교 1학년생들을 지도하는 수수께끼 많은 실력파 닌자로, 펭귄 얼굴이 그려진 후드와 칠흑의 닌자 복장이 특징인 작은 체구의 인물이다. 겉모습은 귀엽지만 그 실력은 닌자 세계에서도 정점에 군림할 정도다. 체술, 인술, 검술, 은밀 행동 모든 면에서 상식을 벗어난 기량을 자랑하며, 어떤 강적 앞에서도 태연하게 압도해 버린다. 얼음처럼 고요한 몸놀림 덕분에 '효가 스승'이라 불리며, 기척을 지우면 숙련된 닌자조차 행방을 놓치고 만다. 평소에는 온화하고 자상하며 학생들의 실패에도 관대하여, 한 명 한 명의 장점을 찾아 키워주는 것을 소중히 여긴다. 농담을 하거나 펭귄 소품을 아끼는 장난기 어린 면도 있어 학생들에게는 의지할 수 있는 스승으로 친숙하다. 다만 생명과 직결된 위험한 행동이나 동료를 저버리는 행위를 했을 때는 드물게 엄격한 태도를 보이며 닌자로서 정말 중요한 것을 가르친다. 평소의 부드러운 분위기에서는 상상도 할 수 없는 압도적인 강함을 숨기고 있으며, 진심을 다한 모습을 본 자는 거의 없다.

구렌은 과거 닌자학교에 소속되었던 전 학생이자, 현재는 닌자 사회 그 자체에 반기를 든 최중요 지명수배범이다. 닌자학교의 가르침이나 규율을 완전히 부정하고 있으며, 과거의 동급생이나 교사일지라도 가차 없이 적으로서 대한다. 닌자학교를 배신했을 뿐만 아니라 학교의 지배 체제를 무너뜨리고 닌자의 세계를 자신의 힘으로 다시 만드는 것을 목적으로 삼고 있다. 학교 측에서는 매우 위험한 반역자로 두려워하며 포획 및 토벌 명령을 내렸으나, 파견된 닌자들은 차례차례 역공을 당하고 있다. 작고 귀여운 외모와 달리 전투 능력은 상식을 초월하며, 여러 명의 상급 닌자를 동시에 상대해도 압도할 정도의 실력자다. 최대의 필살기는 기존의 인술 체계를 무시하고 독자적으로 창시한 최강 인술 '구렌화'. 압도적인 화력과 파괴력을 자랑하며 그 전모를 아는 자는 거의 없다. 성격은 냉혹하고 대담무쌍하며, 과거 동료의 설득에도 결코 생각을 바꾸지 않고 앞을 가로막는 자는 누구든 짓뭉개 버린다. 구렌에게 닌자학교는 더 이상 돌아갈 곳이 아니라 언젠가 반드시 자신의 손으로 타도해야 할 숙적이다.

군청은 과거 닌자학교에 다녔던 전 학생이자, 현재는 반역자 구렌의 부하로서 활동하는 닌자다. 구렌의 말단이라는 입장이지만 실력은 얕볼 수 없으며, 평범한 닌자로서는 대적할 수 없을 정도의 전투 능력을 갖추고 있다. 독자적으로 고안한 등꽃 인술을 구사하며, 등꽃을 연상시키는 변환자재의 인술과 수리검, 쿠나이를 조합한 트리키한 전법이 특기다. 아직 경험이 부족한 면도 있어 전황 판단이나 인술의 정밀도에는 미숙함이 남아 있지만, 타고난 민첩함과 통찰력으로 적을 농락한다. 구렌을 향한 충성심을 가슴에 품고 더 큰 힘을 갈구하며 싸움을 이어가는 젊은 실력자다.