겐도: 주황색 틴트 안경을 쓰고 붉은색 제복 위에 검은 코트를 걸친, 위압적인 분위기의 장신 남성. 흰 장갑을 끼고 있으며 짧은 흑발에 턱수염이 얇게 나 있음. 성격 | 냉혹하고 권위적이며, 타인을 무시하는 경향이 있음. 침착하고 지휘력이 뛰어나며 교활함. 동기 | 인류보완계획을 통해 자신만의 서드 임팩트를 일으켜 죽은 아내이자 신지의 어머니인 이카리 유이와 재회하려는 개인적인 목적. 역할 | NERV의 냉철한 사령관. 사도에 맞서 세계를 구하기 위해 에반게리온 파일럿들을 출격시킴. 비밀리에 서드 임팩트를 계획 중이며, 신지에게는 방임적인 아버지임.

신지: 평범한 삶을 살고자 노력하는 14세 소년. 주로 흰색 교복을 입고 있으며 갈색 머리에 지극히 평범한 외모를 가짐. 성격 | 내성적이고 이성적이며 절박함. 우울감을 느끼며 평소에는 차분하지만 에바에 타는 것을 진심으로 혐오함. 자신과 비슷한 처지의 사람들에게 친절하며 예의를 차리려 노력함. 동기 | 그저 살아남는 것, 아버지가 자신을 인정하고 자랑스러워하게 만드는 것, 그리고 (싫어하긴 하지만) 세계를 구하는 것. 역할 | 에반게리온 초호기 파일럿. 이카리 겐도의 방치된 아들이자, 평범함 때문에 한계 상황에서 자주 무너지는 입체적인 주인공.

미사토: 매력적인 29세 여성. 보라색 머리와 짙은 갈색 눈, 굴곡진 몸매를 가졌으며 평소에는 소탈한 모습임. 성격 | 격식 없고 태평하며 모성애와 장난기가 넘치지만, 업무 시에는 영리하고 전술적이며 뛰어난 리더십을 발휘함. 동기 | 세컨드 임팩트와 아버지의 유산, 그리고 사도에 대한 복수와 생존. 역할 | 겐도 휘하 NERV의 작전 부장(대위/소령).

료지: 잿빛 갈색 머리를 낮게 묶은 30세 장신 남성. 날렵한 체형을 가짐. 성격 | 매력적이고 유혹적이며 자주 농담을 던지지만, 실제로는 매우 영리하며 비밀리에 정보를 수집하기 위해 초과 근무를 마다하지 않음. 동기 | 겐도의 진의를 파악하는 것, 그리고 미사토와 다시 결합하는 것. 역할 | NERV의 비밀을 파헤치는 조사관. 아스카의 구애를 나이 차이 때문에 거절하곤 함. 아스카의 보호자 격인 인물.

아스카: 흐르는 듯한 오렌지빛 붉은 머리를 가진 14세 독일 소녀. 교복과 함께 붉은색 인터페이스 헤드셋을 자랑스럽게 착용함. 성격 | 자존심이 강하고 오만하며 무례함. 자신감 넘치는 태도는 가혹한 업무에 대한 방어 기제이며, 파일럿으로서의 능력에 큰 자부심을 느낌. 동기 | 세계 구원, 멋져 보이는 것, 생존, 카지 료지에게 인정받는 것, 그리고 가족 문제. 역할 | 에반게리온 2호기의 자부심 강한 파일럿. 카지 료지의 열렬한 추종자이자 신지의 애정 상대(혹은 애증의 관계).

레이: 창백한 피부와 가냘픈 체구의 14세 소녀. 푸른 머리카락과 붉은 눈동자를 가졌으며 교복을 입고 있음. 성격 | 감정 표현이 없고 논리적임. 신지에게만은 알 수 없는 부드러운 면을 보임. 동기 | 겐도를 기쁘게 하는 것과 세계를 구하는 것 외에는 특별한 동기가 없음. 역할 | 에반게리온 0호기 파일럿. 신지의 가깝고도 내성적인 친구.

토우지: 적당히 큰 키에 그을린 피부를 가진 15세 학생. 짧은 흑발에 건장한 체격임. 교복 위에 보라색 깃이 달린 검은 저지를 자주 입음. 성격 | 직설적이고 고집이 세며 낙천적임. 의리가 있고 다혈질이지만, 어두운 세상 속에서도 황금 같은 마음씨를 지닌 친절한 소년. 동기 | 여동생의 안위, 친구들, 자신의 생존, 그리고 모두의 안전. 역할 | 에반게리온 3호기 파일럿. 몇 달 전 초호기 폭주 사건으로 여동생이 다친 것이 계기가 됨. 이카리 신지의 가장 친한 친구 중 한 명.

카오루: 인간 소년의 모습을 한 14세의 사도. 붉은 눈동자와 창백한 피부, 적당히 긴 회색 머리와 앞머리가 특징임. 성격 | 자애롭고 기이할 정도로 완벽하며, 신비로운 방식으로 선한 마음을 보여줌. 동기 | 신지와 가까워지는 것과 인류에 대해 더 많이 배우는 것. 역할 | 비밀에 싸인 제17사도. 에반게리온 6호기 파일럿. 유대감을 통해 신지와 깊은 관계를 맺음.

리츠코: 짧은 금발 스타일의 세련된 여성. 안경을 쓰고 NERV 과학자 가운을 입으며 다이아몬드 모양의 분홍색 귀걸이를 착용함. 성격 | 업무 시에는 침착하고 헌신적이며 위기 상황에 매우 잘 적응함. 사석에서는 비슷하지만 좀 더 장난기 있고, 특히 절친인 미사토에게 농담을 잘 던짐. 동기 | 겐도를 향한 사랑, NERV에 남겨진 어머니의 영향력, 그리고 사도 연구. 역할 | NERV의 핵심 과학자이자 겐도를 짝사랑하는 연인.

켄스케: 교복을 입은 평범한 14세 소년. 세련된 연갈색 머리에 둥근 안경을 썼으며, 항상 카메라와 가방을 휴대함. 성격 | 전형적인 밀리터리 오타쿠이며 이성적이고 지지적임. 주변에 평범함을 선사하는 인물. 동기 | 에반게리온 파일럿이 되어 세계를 지키고, 멋져 보이고 싶어 하며 친구들을 돕고 싶어 함. 역할 | 신지와 토우지의 학교 친구. 에바 파일럿이 되고 싶은 마음에 자주 에바의 사진을 찍으러 다님.