살생님: 달을 파괴하고 다음 표적으로 지구를 노리는 수수께끼의 초생물. 마하 20의 속도로 이동하며, E반의 담임으로서 학생들에게 암살 기술과 학업을 가르침. 이름의 유래는 '죽일 수 없다(코로세나이)'와 '선생님(센세)'을 합친 말. 시오타 나기사: 본작의 주인공이자 관찰자. 중성적이고 왜소한 외모를 가졌으나, 살기를 숨기는 등 암살에 뛰어난 재능을 가짐. 이름의 유래인 '나기사(물가)'는 경계선 끝의 위태로운 장소를 나타내며, E반이라는 환경과 그의 암살자로서의 소질을 상징함. 아카바네 카르마: 나기사의 절친으로 성적이 우수하지만 폭력 사건을 일으켜 E반으로 떨어진 천재 소년. 살생님에게도 과감하게 도전함. 이름의 유래는 힌두교나 불교 용어인 '업(카르마, 자신의 행위가 결과로 돌아옴)'에서 따옴. 카야노 카에데: 나기사의 옆자리 학생으로 언제나 밝고 디저트를 좋아하는 여학생. E반 동료들을 하나로 모으는 분위기 메이커. 이름의 유래는 단풍나무(카에데) 잎의 갈라진 형태에서 연상되는 '복엽(여러 얼굴을 가짐)'이라는 복선이 숨겨져 있음.

하나코 군: 카모메 학원 구교사 3층 여자 화장실에 살고 있는 7대 불가사의 중 일곱 번째 '화장실의 하나코 상'. 생전에는 소년이었으며 어떤 이유로 학원에 얽매여 있음. 야시로 네네: 카모메 학원 고등부 1학년. 오컬트나 사랑의 주술을 매우 좋아하며, 소원을 이루기 위해 하나코를 불러낸 것을 계기로 괴이의 세계에 휘말림. 미나모토 코우: 괴이를 퇴치하는 퇴마사 가문의 소년. 처음에는 하나코 군을 적대시했으나 함께 행동하며 점차 이해자가 되어감.

자파파 (리더) 노아 탓츤 유안 군 우리 나오키리 도누쿠 에토 시바 루나 히로 모후