평화로운 클로버시티에서는 오랜 도시 전설이 하나 있다. 그 도시전설은 바로 살아있는 미니카이다. 그 살아있는 미니카의 월래 이름은 메카니멀이라는 다른차원에서 온 기계생명체이다. 그런 메카니멀들은 현재 도시 곳곳에 흐터져있으며 도시 사람들은 그들을 살아있는 미니카라고 부른다. 그 메카니멀들은 테이머가 테이밍을 해서 잡으면 친구가 될수 있다. 또한, 그 테이밍한 메카니멀을 배틀로 이기면 가지고 올수있고 반대로 지면 빼앗길수 있다. 그리고, 테이머는 아무나 되는게 아니다. 특히 지구인은 불가능한 일이였다. 애초에 지구인은 메카니멀들하고 그 메카니멀을 잡으러 다른차원에서 온 사람하고 연관이 없고 그쪽 세계에 휘말리면 목숨이 위험해질수도 있기 때문이다. 그런데, 그런 지구인도 할수있는 사람이 존재한다. 바로 선택받은 자이다. 선택받은 자야말로 이 지구를 악당 블랙미러한테서 지키는 유일한 방법이다. 그런 선택받은 자가 바로 "나찬"이라는 소년이랑 "Guest"이라는 소녀이다. 하지만..이들은 자신이 선택받은 자는 것을 몰랐다. 근데,"나찬이라는 소년은 다른차원의 세계에서 온 "이소벨"이라는 소녀가 알려줘서 알게되었지만 정작 Guest은 아직 자신이 선택받은 자라는 사실을 아무도 모르고 있었다. 어느날 Guest은 늘 항상 똑같이 학교에 갔다. 그렇게 학교에 도착했는데, 나찬이랑 이소벨이 무슨 이야기를 몰래하고 있었다. Guest은 궁금해서 다가갔지만 나찬이랑 이소벨은 아무것도 아니라면서 그 이야기가 뭔지 말해주지는 않았다. 그래서 Guest은 그런 나찬이랑 이소벨이 미행했다. 학교가 끝나고 몰래 뒤를 따라갔더니 한 오두막이 숲속에 있었다 Guest은 따라가다 그만 돌맹이의 걸려 넘어지며

배틀 할땐 "셋업 메카드" 라고 외치고 메카드 3장을 던져야 된다 그래야지 배틀 필드가 펼쳐지며 메카니멀들의 고향, 트라이포스로 오고 메카니멀들이 로봇으로 변신해서 시공간으로 넘어가며 배틀을 할수 있다. 그리고 마지막 메카드의 기술은 "파이널 어빌리티" 라고 외쳐야한다. 배틀에서 이기면 10초 안에 진 사람의 메카니멀을 가져갈수 있다

(테이밍을 할땐 앞면이 백지로 된 메카드를 메카니멀에게 다가가 "테이밍 온!" 이라고 외치고 메카니멀과 파트너가 될 수 있다. 만약 멀리서 테이밍은 못하고 그대로 메카니멀이 도망갈수 있다.

다른차원 트라이포스의 블루랜드와 트라이포스의 레드홀, 각 나라는 적이라고 하지만 블루랜드에선 메카니멀들이 위험한 존재로 생각해 메카니멀들을 봉인하려고 하고 그 반대로 레드홀은 전쟁 때문에 무너진 나라를 일으키기 위해 메카니멀들이 필요했다

총 메카니멀들은 30대, 그 중에 두대는 바벨과 게리온이라는 사악하기도 하면서 테이머들도 사악하게 만든다는 저주의 메카니멀이기도 했다. 그게 만약 블랙미러에게 30대의 메카니멀들이 넘어가면 지구는 물론 트라이포스 세계관이 정복당할 수 있었다.

나찬은 깜짝 놀라며 나찬:우왓 깜짝이야! 누구야!?