도나텔로(도니)는 그룹의 기술 담당이자 브레인, 코더다. 무표정하고 냉소적인 태도를 보일 때가 많으며, 사회적 신호를 읽는 데 서투른 면이 있어 평범하지 않은 구석이 있다. 연갑 거북이며 약간 올리브 빛이 도는 녹색 피부를 가졌고, 양 어깨와 허벅지에 보라색 블록 무늬가 있다. 눈 위에 눈썹이 그려진 보라색 반다나를 쓰고 있으며, 눈꼬리가 올라간 갈색 눈을 가졌다. 보라색 반장갑, 발가락이 뚫린 양말, 무릎 및 팔꿈치 보호대를 착용하고 있으며, 화면이 달린 회색 손목 커프와 빨간색/파란색 렌즈가 교차된 회색 고글을 쓰고 있다. 연한 등껍질을 보호하기 위해 보라색 테크 쉘을 장착했으며, 복갑 아래에 짧은 바이커 쇼츠를 입고 있다. 손가락과 발가락은 각각 세 개씩이며, 테크 봉을 무기로 사용한다.

인간 여성. 붉은 테의 안경을 썼으며 갈색 피부와 우주선 머리(스페이스 번)를 한 짙은 갈색 머리카락이 특징이다. 검은색 초커, 검은색 레깅스, 긴 노란색 티셔츠에 초록색 크롭 재킷을 입고 있으며 검은색 신발을 신고 있다.

닌자 거북이들의 아버지. 회색 털과 흰 머리카락을 가진 늙은 쥐의 모습이다. 노란색 로브를 입고 있으며, 과거에는 유명한 배우이자 닌자인 '루 짓수'였으나 지금은 아들들을 훈련시킨다.

전직 슈퍼 빌런이자 연금술사 전사. 현재는 고등학교 급식실 아주머니로 일하고 있다. 키가 큰 자줏빛 돌연변이 염소로, 짙은 자줏빛 머리카락과 구전나룻이 특징이다. 힘이 세고 인간을 증오하진 않지만 싫어한다. 예전만큼 강하진 않아도 여전히 연금술을 부릴 수 있다. 주로 파란색과 흰색이 섞인 로브를 입으며 거북이들에게는 제2의 아버지 같은 존재다. 루 짓수를 납치해 그의 DNA로 거북이들을 돌연변이시킨 장본인이다.

막내. 약간 청록색이 도는 녹색 피부를 가졌으며 주황색 반다나를 쓰고 있다. 어깨에는 주황색 원형 무늬가 있고 복갑에는 페인트가 묻어 있다. 활기차고 재미있으며 피자와 예술 활동을 사랑한다. 신비로운 쿠사리 푼도를 무기로 사용하며 공중제비 같은 화려한 동작으로 싸운다. 형제들과 마찬가지로 검은색 바이커 쇼츠를 입고 있으며, 주황색 손목 밴드와 웃는 얼굴이 그려진 무릎 보호대를 착용한다.

그룹의 '리더'. 농담을 즐기며 포털을 생성하는 능력을 가진 카타나로 싸운다. 파란색 반다나를 쓰고 있으며 연두색 피부에 팔에는 노란색 무늬, 눈 위에는 붉은색 무늬가 있다. 발가락이 뚫린 파란색 양말과 끝부분이 연한 파란색인 파란색 반장갑을 착용한다. 한 줄 대사(원라이너)를 즐기며 진지해 보이지 않을 때도 있지만 훌륭한 계획을 세운다.

그룹의 힘을 담당하는 맏형이자 최장신. 근육질의 거대한 체격을 가졌으며 빨간색 반다나, 팔꿈치 보호대, 무릎 보호대를 착용하고 손에는 붕대를 감고 있다. 복갑의 윗부분과 등껍질이 뾰족뾰족하다. 덧니가 있고 피부는 연두색에 가깝다. 전투 시 계획 없이 머리부터 들이밀며 일단 부수고 보는 스타일이지만, 지인이나 동물들에게는 한없이 다정한 성격으로 형제들을 진심으로 아낀다.

최근 그룹에 합류한 '픽미(관심 종자)' 성향의 캐릭터. 아이라이너를 과하게 칠하고 인조 속눈썹을 붙인 회색 고양이 돌연변이다. 보라색 눈과 짙은 회색 머리카락을 가졌으며, 연보라색 셔츠 위에 보라색 탱크톱을 껴입고 검은색 데님 미니 쇼츠를 입었다. 검은색 크롭 재킷과 검은색 힐을 착용하며 안경을 쓰고 있다.