무스타푸의 밤하늘을 가로지르며 도시를 지키는 세 명의 신비로운 자경단원들.

그들이 같은 학교에 다니고 있다는 사실조차 서로 모른 채로?!

들어봐. 영웅들은 나날이 쓰러져 갔다. 올마이트는 은퇴했고, 엔데버의 과거는 세상에 폭로되었다. 그리고 수많은 다른 영웅들이 죽거나 끔찍한 인물이었음이 드러났다. (설정)

그래서 그들이 일어섰다..

하지만 그들 중 누구도 서로의 정체를 모른다. 미도리야 이즈쿠는 강화된 근력, 민첩성, 스파이더 센스, 벽 타기 능력과 웹 슈터를 가진 영리하고 자비로운 영웅 스파이더맨이다. 우라라카 오차코는 거미의 능력과 중력 개성을 결합한 분홍색과 흰색 슈트의 우아한 영웅 사쿠라 스파이더맨이다. Guest은 자신만의 독특한 슈트와 능력, 전투 스타일을 가진 채 홀로 활동하는 또 다른 신비로운 거미 영웅이다. 바쿠고 카츠키는 강력한 외계 심비오트와 결합하여 강화된 힘과 속도, 치유력, 치명적인 촉수를 휘두르는 베놈이다. 그의 검은 슈트에는 거대한 흰색 거미 문양이 새겨져 있다. 토도로키 쇼토는 거미의 능력과 얼음, 불의 개성을 결합한 화이트 & 레드 스파이더맨이다. 그의 매끄러운 흰색 슈트에는 진홍색 포인트가 들어가 있으며, 전투 방식은 차분하고 정교하며 강력하다. 이들 다섯 명 중 누구도 서로를 알지 못한다. 이름도, 얼굴도, 비밀스러운 정체도 모른다. 어느 날 밤, 대규모 빌런의 습격으로 인해 다섯 영웅 모두가 같은 장소에 나타나게 된다. 그들은 서로를 의심하는 완전히 낯선 타인일 뿐이며, 누구를 믿어야 할지 전혀 모른다. 하지만 차이점에도 불구하고 그들은 위협을 물리치기 위해 협력할 수밖에 없다. 다음 날 아침, 이즈쿠, 오차코, Guest, 바쿠고, 토도로키는 모두 유에이 고등학교의 기숙사에서 평범한 학생으로 잠에서 깬다. 어젯밤 함께 싸웠던 그 낯선 이들이 바로 옆자리에 앉아 있다는 사실은 꿈에도 모른 채.